毛泽东第三次来到特园，说蒋承认各党的合法地位，并同意召开政治会议，但军队和解放区的政权还是没有解决。他表示，谈判无实质进展。

国民党一边谈判，一边向对共的各大战区运送大量的兵力物资。张澜在各大报纸发表致国共两党公开信以此劝阻内战的爆发。蒋介石请张澜会面要他劝说共产党，可以停止内战，但是政令军令必须掌握在他的手中，张澜彻底失望了，他质问蒋：那还谈什么呢？

在各方努力下，国共双方最终签订了“双十协定”，张澜等人送别毛泽东返回延安。民盟全国代表大会召开，张澜连任民盟主席，并在会上限制了青年党的一些活动。蒋介石发布剿共密令，在华东解放区再次开始了内战。

延安方面也在调兵谴将，积极应对内战。张澜向国共两党致公开信，要求在元旦停止武力冲突，并召开政治协商会议。蒋介石同意在召开政协会议，但在停战协议上把东北排斥在外；并让青年党以独立单位参加，但名额在民盟中扣除。同时他要求张群将民盟中央的宣传部长罗隆基拉过来为己所用。张群尊蒋之命利诱罗隆基，除国防部长和外交部长外，其余部长任他挑选，罗不为所动。

民盟在讨论参加政协会名单时，为争名额产生分歧，青年党要求5个名额，民盟各党派不同意，青年党就以退盟以要挟。周恩来提出共产党和国民党各让出名额，才平息了事件，同时他与民盟订立“君子协定”，今后，凡遇重大问题，双方一定提前通气协商决定。张澜与周恩来握手为盟。

政治协商会议虽然通过了五项决议，但国民党反对和平民主、独裁内战的本质未变。其后更制造了“较场口血案”，砸毁《民主报》、《新华日报》编辑部。王若飞在回延安途中遇难。中共军队顾全大局撤出长春。蒋介石竟讥讽道：他们知道打不赢才撤军的。蒋率国民党政府还都南京。民盟总部也由重庆迁至南京，但张澜未去南京而返回成都慈慧堂。

1946年，内战全面爆发，身在昆明的李公朴、闻一多立刻成立反对内战委员会，召开大会呼吁和平。随后李公仆在回家途中遭到国民党特务的暗杀，三天后，闻一多在李公仆的追悼会上，用生命完成了《最后的演讲》后，他和儿子同时被特务暗杀在自己的家门前。短短五天，两桩血案震惊国人。张澜闻讯怒斥当局的无耻和黑暗，决意以民盟的名义在成都召开声势浩大的悼念活动。特务机关得知情况立刻部署扰乱计划。

张澜在成都蓉光电影院为二人举行追悼会，徐中齐让特务混进去喊口号企图扰乱会场未果，于是在张澜等人出门时向其投射石灰粉，玻璃瓶等，张澜被击中头部鲜血直流，紧急关头，一支便衣队车队冲出来保护着张澜离开蓉光电影院，原来是地方军潘文华秘密派来的。为此，全国的名人学者和社团组织都纷纷上书政府，要求严惩凶手张群撤消徐中齐的职务。

国民党要求召开国民大会，并要民盟提出参加会议的名单，张澜提出不停止内战就不能召开国民大会，周恩来表示解放区一天不停止枪声，共产党就决不不参加国大。蒋介石就提出两点要求，如中共同意就停止内战。中共无法接受蒋的无理要求。

梁漱溟代表民盟提议国民党停战，同时共产党提出国大名单，让美国监督蒋介石。蒋介石一方面占领解放区张家口，一方面强制宣布召开国民大会，民盟无从调停。张澜在四川召开记者会，宣布决不去南京，并且也不参加国大。

司徙雷登劝说罗隆基让民盟先参加政府国大再设法停战，罗隆基拒绝了。张群以重金利诱民盟中央秘书长、青年党负责人左舜生，表示他可以让青年党以独立党的身份参加国大。左舜生接受张群的条件。民盟主委张君劢的胞弟张公权劝说他参加国大，张君劢犹豫不决。

张澜向中共代表吴玉章保证民盟不会参加国民党一党专制的国大，黄炎培、梁漱溟等人在南京努力挽留，不愿再听任蒋介石摆布的周恩来，希望找出双方都能接受的方案，并以民盟参加与不参加国大来对付破坏和平的一方。

茂延和蒲生等进步学生在成都被捕，张澜赶到成都解救。梁漱溟等人写了折中的方案，分别送交给国民政府、美国使馆和中共周恩来三个方面，因方案中涉及中共又将被迫放弃21个县的解放区，如此大的决定，民盟事先未能与中共协商，周恩来痛心而去，梁树冥等又赶紧到各方收回方案。

蒋介石答应国大延期，但是第三方面必须保证交国大名单，梁漱溟心灰意懒离开南京。张君劢、罗隆基等人联名写了一封信要求国大延期，周恩来得知后，说这是蒋介石的圈套，张申府等人又去将名字涂掉，张君劢哀叹民盟的现状，宣布从今往后民社党将独立行动，左舜生怒斥涂名行为，也宣布青年党决不做牛后。

张君劢交了民社党参加国大的名单，但是自己却除外。在南京的民盟的成员得知消息后在周恩来提醒下给张澜打电话请示，张澜表示民盟坚决不参加国大。民盟在报纸上公开表示不参加国大。张君劢及民社党被民盟开除。

张澜离开成都来到上海并表示民盟不参加改组政府，民盟一届二中全会在上海召开，张澜连任民盟中央主席。

蒋介石密令将民盟成员杜斌丞以通匪为名杀害，由此反共气焰愈演愈烈。周恩来撤离上海前受委托民盟保管中共财产，张澜郑重受理，令罗隆基妥为保存。国民党在各地对民盟成员进行大肆抓捕，西北民盟主委杜斌承被捕。

周锋在这次的白色恐怖中也被乐伯勋迫不及待的抓捕了，求救无门的蒲瑛试图找乐伯勋拼命救出丈夫。险些遭他欺辱。张澜得知后请张群出面将蒲瑛救出，却无法解救周锋。

各地民盟总部被查封，罗隆基也被监视起来。司徙雷登告诉罗隆基，民盟必须自行解散，否则就要逮捕700多名民盟成员交军事法庭秘密处置。蒋介石宣布民盟是非法团体，必须自行解散，由陈立夫与民盟交涉，黄炎培、罗隆基、史良等人给张澜汇报。张澜为了全体盟员及亲属生命安全，迫不得已签上了自己的名字。

1947年11月民盟被迫解散，但张澜以个人名义公开发表声明：民盟是被迫解散的。司徒雷登向叶笃义建议张澜和黄炎培、罗隆基三人去政府帮助蒋介石，被其拒绝。

民盟各支部由公开转到地下仍在活动，张澜让沈钧儒去香港成立民盟临时总部，发表民盟被迫解散的声明是无效的，并召开民盟三中全会。

刘邓大军进驻大别山，全国的战局开始逆转，中共由防御转向进攻。中共建议召开新的政治协商会议，民盟向中共提出三条要求。

蒋介石发表引退公告，李宗仁宣布代行“总统”职权，张澜公开说这是一个骗局，并希望毛泽东按照《新民主主义论》建设和治理新国家，而不要服从共产情报局的政策。邵力子希望民盟能出面调停国共双方，促进和平，张澜拒绝。

张群回四川赴任，张澜希望其释放政治犯，少征兵少征粮，张群一一允若。杨森请已一心搞学术研究的梁漱溟重新出山，继续为国共和谈奔走，遭梁拒绝。

张澜突然病倒，被送往上海虹桥疗养院，在丁院长的劝说下住院治疗。

1949年，南京解放，又从台湾返回的蒋介石下令处决所有在押的政治犯。并逮捕张澜、和罗隆基。上海警察局长毛森命令阎锦文逮捕张澜和罗隆基，在医生郑定竹的保证下，二人被软禁在疗养院。