黄兴等人推举孙中山为大总统，宋教仁提出不同意见，不赞同总统制。孙中山向大家阐述了实行总统制的理由，得到大家赞同。孙中山当选为中国民国大总统，袁世凯听闻后，恼羞成怒。

孙中山在戏院看戏时，遭人行刺，多亏卫士搭救，逃过一劫。孙中山政府由于资金紧张，难以维系，袁世凯听闻幸灾乐祸。孙中山发表声明，只要袁世凯赞成共和，就同意让出大总统一职。革命党试图刺杀袁世凯，但遭到失败。

孙中山宴请蔡云培，蔡请求孙中山给康有为安排职位，遭到孙的拒绝。袁世凯在报纸上发表声明赞成共和。革命党人在北京炸死宗社党人良弼。隆裕太后惊慌失措，称一切都交袁世凯处置。袁世凯逼迫清帝退位。

蔡元培作为南方代表进京面见袁世凯，提出袁世凯应该在南京就任大总统。但是袁世凯以北方局势不稳为由推辞。袁世凯命令曹锟安排一次假军事政变，制造动乱的局势。

孙中山辞去了中华民国大总统一职。袁世凯就任大总统后先后解散两任内阁，引起社会不满。袁世凯邀请孙中山等人来京，黄兴建议先由他去探探形势。袁世凯和黎元洪密谋杀死了张振武，随后却在报纸上公布了黎元洪发给袁世凯的密电，黎元洪气的吐血。

孙中山前往北京，袁世凯在总统府会见了孙中山。袁世凯为防范孙中山，派他负责在全国修建二十万里铁路事宜，孙中山没有意识到袁世凯的诡计，离京赴各地调研。宋教仁领导国民党取得国会选举胜利，引起袁世凯恼怒。袁世凯派人刺杀了宋教仁。