永乐十一年，杭州。入夜后的香草院热闹非凡，死人的喊叫声音让那里顿时乱成一团，老鸨进屋查看发现客人死在床上，死者傅玉堂官至侍郎，是京城大官，老鸨急忙报官。杭州知府吴之问收到消息后派人赶往现场并封锁消息，香草院的老鸨和姑娘们被带走审问，老鸨否认杀人。

老鸨解释傅玉堂被杭州府的马车送去，打着吴府的灯笼，还拿出十两银子为证，吴之问陷入被动，他因牵扯案情而回避，案件交由洪通判审理。铁面御史周新无事在京城街上闲逛，看到饭馆有人闹事就出面调解，饭里的老鼠屎被揭穿，闹事之人被众人斥责，周新拂袖而去。纪纲岳父六十大寿，所邀人员如约而至，周新进门后从夫人手中看到一张纸条。

纸条上的内容让周新意外，他清楚朝廷要出大事，周新要找送信之人，他相信自己出现后对方会现身。周新猜出送信的人是思琪，思琪在野外现身，她说明傅玉堂之死，思琪劝周新不要多管，周新执意查案，思琪愿意追随左右，她从未考虑终身大事。

吴之问死在衙门，洪通判和推官余人杰发现后立即封锁府衙，但消息还是很快传出去。余人杰去找洪通判商量时被家丁拒绝，洪通判借故生病不见旁人。锦衣卫包围了吴之问的家，余人杰一时间不知如何是好，吴之问家中搜出大量金银财宝，吴府所有人员不得离开宅院。

皇上召集从臣商量傅玉堂的死，众人议论纷纷，周新也是大惑不解。刑部和吏部对查案之事一再推托，皇上命周新去杭州查案，周新带圣旨前往，离行前岳父再三叮嘱，思琪又一次劝说，但周新坚持去杭州，思琪要陪他一同前往，她不能看着周新陷入险境。

周新在城门口遇上纪纲，纪纲提醒他此行要当心，周新和他道别后坐马车而去。思琪尾随周新去了杭州，周夫人在桌上看到她留下的信件。周新到杭州后查看吴之问和傅玉堂的遗体，洪通判仍躲藏在家中不敢出来，余人杰对周新的到来表示敬佩，周新清楚案件复

周新来到牢房，老鸨等人大喊冤枉，单独关押的梅春引起了周新的注意，当时傅玉堂就死在她的房间，周新询问梅春，他命人释放她并在外面安置清静的房间，老鸨等人也被放出。梅春在周新面前讲述她看到情况，她也曾感觉到奇怪的地方，梅春那晚离开房间一个多时辰，香草院的杂役值得怀疑，梅春否认和傅玉堂发生关系，周新让她呆在屋里不要乱跑。

周新在余人杰的陪同下来到洪通判家中，洪通判的房间乱成一团，他躲藏在床上装疯卖傻，周新准备上报京城让余人杰担任通判之职，当出门时收到梅春死亡的消息，老鸨等人消失。周新带人寻找送饭的伙计，张万和李顺赶马车追赶，周新进店发现可疑人之后追赶至一片树林，几名黑衣人围住他，思琪突然出现击退歹人。

思琪一直暗中保护周新，周新感觉事情蹊跷，他判断有人故意所为。纪纲建议把浙江按察使的人员归周新调用，皇上采纳，周新被封浙江按察使，余人杰代通判之职。周新给思琪定了几条规矩，他拒绝她当捕快，但可以帮忙处理案情。

周新收到京城消息，他和余人杰假设傅玉堂的行走路线，寻找跟班小扣子成为当务之急。知县穿着便装来到寺庙，他对斗蟋蟀很感兴趣。周新派了很多人寻找小扣子，思琪听到他的话，余人杰找思琪叙旧，她打算亲自出马寻找小扣子，思琪提醒他不要让周新知道。小扣子藏在斗蟋蟀的人群中，县令到时他慌忙跑开。思琪在寺庙打听到小扣子的行踪。

小扣子得知有人要找他时急忙离开，思琪继续沿线索追赶，小扣子故意躲避。秋香从寺庙回去途中被人调换篮子，等她发现多了一个铜镜后十分慌张，匆忙赶路时把脚扭伤。吴之问的夫人吴金自杀，周新和余人杰十分意外。秋香要过河时没赶上船，天色渐黑，无法回家让她担忧，突然出现的男人建议她留在仁和镇，她身上没带钱，那男人答应包她吃喝住，秋香跟他前往。

秋香陪那位男人在仁和镇的旅馆吃饭，思琪女扮男装也去了那家，小扣子出现在门口引起了思琪的注意，她追赶出去，但小扣子故意躲藏。思琪在仁和县衙门口看到知县回来，知县和众人在议论蟋蟀。

小扣子夜里溜入顺风旅馆，思琪见门开着进入住宿。秋香拿着铜镜仔细端详自己，她不明白有何特别之处，突然的敲门声让她有些害怕，来人是河旁遇到的男人，他已喝多。

秋香把门打开，那男人闯入，秋香到处躲藏，他要对她动粗，秋香解释肚子不舒服，她借机出门，那男人躺在床上睡着。小扣子暗中观察县令等人在斗蟋蟀，思琪没能找到他。秋香回房时看到那男人死在地上，她大声喊叫后从屋里跑出，床上的篮子被人翻动。

店老板听到声音后出门查看，店主向县衙禀报，县长闻讯而至。官府对死者验伤并分析案情，思琪在人群中查看，县令没有主意，师爷发现床上的香篮，那是女人所用，询问店主之后了解情况，县令怀疑死者被那女人所杀，师爷猜想可能是因奸情引发的血案，县令命人根据店主的描述画像，并通缉那个女人。

思琪向周新作别，周新拿她没办法，他很担心她，思琪出门寻找线索。小扣子感觉妙香好像换了一人似的，跟到绸布庄仔细观看，等出门后小扣子跟踪她至徐宅。思琪在周新面前提到仁和县发生命案之事，她被县令赶走，周新劝她不要多管。小扣子在街上看到思琪后急忙躲藏，他听到有人议论周新。

妙香也感觉那镜子来路不一般，她向弟弟妙法说起进香时香篮被换之事，弟弟念出铜镜上的字，妙香还提到被杀的男从，她没想到后来会惹事到那么大的事情。妙香让弟弟找理由支开老公，她拿钱去街上买卤肉，等回家时发现一片狼藉。小扣子躲在妙香家，妙香发现黑衣人后躲藏起来，她和小扣子都看到黑衣人杀死老公，妙香老公死在床上，等黑衣人走后大声喊叫，因黑衣人蒙面，妙香也没看清他的样子。

县令再次收到人命案，他正和衙役们斗蟋蟀。周新也听说天官巷命案之事，他不想多管，思琪不解。县令带人来到死者吴阿健家中，他根据现场分析案情，妙香谎称只看到一点点，县令胡乱猜想，师爷画像追捕凶手，思琪在人群中观看县令办案，县令匆忙结案，他命人四处张贴，凡是和画像长得像的人都要抓起来，县令让妙香回娘家投奔弟弟。

妙香出门后思琪进入她家，而后尾随至妙法家中。县令把喜爱的蟋蟀放在官轿中，师爷在一旁拍马屁。纪纲一直在关注着傅玉堂家中情况，他命人备赶往傅府，快到门口时突然改变主意，他派人代自己前往。思琪把找来的线索和周新研究，她聊起对妙香的怀疑，还猜想可能是妙香拿了铜镜才引来杀身之祸，思琪感觉那副画可能是小扣子画的，周新感觉有道理。

思琪找妙香询问铜镜，妙香自称扔了它，妙法因它而死，妙香很害怕，思琪劝她找回镜子，等她们返回寻找时铜镜已经不见，很快从小扣子那里找到。思琪带小扣子和妙香去见周新，周新问起那天去净坛寺烧香之事，小扣子说起他的怀疑，他曾看到过和妙香长得很像的女人，还知道她的住址，周新很感兴趣。

周新身着便装来到仁和县衙，施县令正在斗蟋蟀，周新问起几天前的连环血案，施县令面对询问胡言乱语，小扣子按周新的嘱咐去做。思琪一直盯着和妙香长得相似的女人，黑衣人潜入时被周新当场围捕，小扣子指认他就是杀人凶手，徐觉很冲动，他指责小妾伤风败俗，徐觉认识那面铜镜。

周新说明铜镜刻字的意思，他把之前的案情加以推敲，被盗的包裹藏在房梁上，盗首把暗语刻在铜镜，黑衣人是盗匪的二当家，盗贼和徐家小妾被一并带走。破案后施县令匆忙赶到，周新建议他回乡务农，已上报史部对施县令永不录用。周新赶往湖嘉县，小扣子记得他们曾经住的地方，周新不想让思琪知道，思琪坚持跟随。

余人杰劝周新留下思琪，小扣子在一旁说情，思琪想和大家一起面对，周新最终答应她同行。在小扣子的带领下他们来到悦来客栈，周新清楚当晚迷雾重重，他没有去县衙，直接进入悦来客栈了解情况，店主把看到事情告诉周新等人，河水里出现的死尸被人草草埋葬，小扣子醒来后去了杭州，下船后听说傅玉堂的死讯后躲藏起来，店主带周新等人来到埋尸的地方。

伍知县在县衙里大谈书法，听说工匠争吵时赶去查看，县衙后宅正在修缮，伍知县对两种施工方案都很满意，不知如何选择，伍知县叫去拿纸面和笔墨，他要做最后的决断。周新询问小扣子，他想起小榔头，坟地里的尸骨被挖掘出来，小扣子上前辩认，周新命人继续挖那些坟上不长草的新坟。

伍知县用抓阄的方法来选择施工方案，他抓到高大毛的方案，双方险些打起来，伍知县最终让他们滚蛋，但被杜主薄留下来继续干活。彩凤听到男人姜老七和高大毛的争吵，她送饭时扭头回家，姜老七带着怒气回家，小九跟在后面，彩凤把姜老七推翻在地，小九听到声音后进屋劝说。店主在草丛前祈祷，周新上前询问时把他吓了一跳，见天色已经晚，众人回到客栈。

回客栈后周新和众人分析案情，张万感觉不是江湖中人所为，周新无法说服自己，他猜想背后有人指使。夜里周新难以入睡，看着小扣子让他再次想起小 榔头，思琪看出他的心思，周新相信思琪也不会忘记那些事，思琪叫醒小扣子让他回房休息。思琪看到小扣子画出酒馆里喝酒的那些人，小扣子想留在周新身边，还 求思琪帮忙，思琪给他讲了小榔头的故事。

杜主薄请高大毛和姜老七喝酒，小扣子画的正是他们在酒馆的场景，杜主薄喝酒时借机离开，高大毛和姜老七都已喝多。思琪等小扣子睡后给周新端茶， 她提起小扣子的想法，小榔头是周新心里的伤痛，周新不想让周围的陷入囹圄，思琪心甘情愿做那些事情。酒后高大毛和姜老七厮打起来，旁人将他们拉开，出门后 各自离开。

周新夜里醒来，他来到思琪房门前敲了两下，思琪没有开门，周新离去。江南科考舞弊让皇上震怒，皇上怀疑和朝廷要员有关，傅玉堂的死让事情捉摸不 定，皇上敦促周新尽快破案，纪纲故意和周新过意不去，岳父劝他收敛。周新和思琪去了县衙，张万等人继续寻找死尸。周新为了避嫌让思琪一个去湖嘉县衙，姜老 七迟迟没去干活，小九前去寻找，到姜老七家里时才知道他一夜未归。

思琪看到湖嘉县衙那些从河里打捞出来的无名尸体案的卷宗，彩凤来到县衙门前击鼓喊冤，她说明姜老七一夜未归之事，还怀疑姜老七被人陷害，高大毛 成为嫌疑人，伍知县审问高大毛，周新在堂外听到。小九说明那夜高大毛和姜老七同一路回家，高大毛解释原委，高大毛记不清何时回家，他老婆带着孩子回了娘 家，无人作证。伍县令分析高大毛和姜老七有利益之争，高大毛家中发现一摊血渍，伍县令叫伍作去现场勘察，高大毛被押入大牢随时听审。

杜主薄奉命勘察，思琪发现一份验状和他们寻找的是同一案件，她把情况告诉周新。小扣子看到可疑尸体，他记得护卫的左臂有一处刀疤，周新确认了死 者身份，多亏了小扣子的提醒。思琪和周新发现鸡毛藏在草垛中，伍作和捕头回去向伍知县汇报情况，他们没找到隐藏的尸首，伍知县命人继续寻找。周新的突然到 来让伍知县十分惶恐，伍知县对案件胸有成竹。