白贤对宋慈的到来，有些惊惶，问案中有何不妥。宋慈说虽有遗扇为证，却少了赠扇人郑玉的旁证。白贤深夜下狱，再问郑玉其人。吕坚称并无此友。宋慈进而又指出案发在四月初三，是夜细雨绵绵，天气寒冷，凶手为何带携扇作案？白贤听此一说，深感审案确有疏漏，愧恨之下，竟昏倒在地。看着昏睡在床的白老知县，宋慈不禁想起承受不起过错而以死谢罪的父亲而潸然落泪。宋慈看着扇面题字，忽然觉得诗文眼熟。再去深巷酒肆，果然见墙上题诗与扇面的是同一首诗。可酒肆老板王二却怎么也记不起题字的王传是何方人氏。王二老婆珠儿突然端酒菜上楼，有意无意地推开窗子，宋慈居高临下地从酒楼窗口看到了对门童四正给亡妻做着祭事。珠儿话中有话，可宋慈反感窑子出身的珠儿那一身媚气而离开了酒肆。

宋慈和白贤再去童家，在童家内房的窗台前，宋慈忽见王二老婆珠儿正在对门楼上向童家探望。宋慈此时才想起昨天珠儿话中似有别音。急急赶往王二酒肆，珠儿细说了当时王传和几个读书人在此喝酒的情景。正说着，王二突然上楼，说他终于想起来，王传家住邻县凤阳。宋慈注意到王二鞋底沾着黄泥。宋慈赶到凤阳，拿出扇子，王传说诗是他作的，但扇面上的字却像出自他好友郑鉴手笔。捕头王率捕快赶到黄泥岗陈鉴家时，却见陈鉴早已中毒身亡。现场遗留的一股浓郁的酒香，让宋慈猛地想到了真凶正是酒肆王二。法堂上，宋慈仍推白贤高坐，自己陪审。

王二因在楼上窗口窥见对门何氏美貌，趁童四出门在外，深夜潜入童家，意欲行奸，何氏拼死不从，王二遂杀何氏奸尸，事后设下遗扇嫁祸之计，使吕文周蒙冤，眼看案情败露，又杀为他扇面题字的陈鉴灭口，宋慈将案情推得如履其境。王二却说没有实证而不能定其死罪。宋慈开棺验尸，死者刀伤右浅深，右窄而左宽，正是王二这个左撇子所为。铁证面前，王二伏法，吕文周得以重见天日。而白贤老知县却悄悄挂冠，携老伴如释重负地回归故里。楼家为女儿订亲喝酒至深夜。清晨家人急报：小姐死于后花园枯井之中，井中另有一未死男子，是在楼家教书的落魄秀才梁雨生。县衙，知县刘皓质问梁雨生：如何与小姐外出？梁说，昨夜与小姐相约私奔，不想竟跌下枯井……

刘皓认定，既是相约私奔，为何未带行李，而小姐带的银财在他身上？必是谋财害命。宋慈读梁雨生案卷读出疑问，即潜入楼宅枯井处查看，捡得一小儿饰物——狮形的铜挂锁。宋慈告知刘皓此案有疑点。二人同去狱中探视疑犯梁雨生。那人如疯如癫，痴念着已死的小姐。宋慈问梁如何与小姐相约。梁说，那夜喝酒后回房看到桌上有纸条，小姐约他私奔他乡，故急急赴约，谁知害了小姐性命。宋慈与刘皓去楼家查探。宋要看梁雨生住的屋子。但屋里没有任何信件或诗稿。楼员外说，因痛恨梁害死女儿，将他的东西扔掉了。宋慈又进小姐住房查探。见壁上贴着一首词，写得缠绵温柔。楼员外说是女儿写的，宋却认定是男人所作。又见火盆里有烧剩的一点纸片，上有词中之字，但笔迹不同。随即提出要验尸。验尸得知楼家女儿身怀有孕。

宋慈从狱中叫出梁雨生，有意吟起小姐房里的那首词，梁雨生即说此词是他所作，即写下整首词。又说与小姐只是隔墙遥望，从未私会。刘皓说你把小姐肚子弄大了，还说这话？梁大喊冤枉，说诗文是楼家小儿交丫环，再转小姐的。宋慈想到丫环是关键人物。再去楼宅，丫环已用剪刀自杀。宋慈细察其伤势，认为是他杀。又发觉死者指甲内有血迹，而楼员外左边脸颊恰有两道抓破的血痕，楼夫人说是她睡梦中不慎抓破的。刘知县提出见解：楼员外恨女儿与穷秀才相好，一时气急，将二人推入井中。此事让丫环看到，只得杀丫环灭口……宋慈否认楼员外杀人。要刘皓在全城搜捕凶手，凡脸有破痕者都要细加询问。

英姑暗随一个脸上有抓痕的男人，见其走进一座破落小院。稍后，楼夫人携宝儿去私塾读书，不一会也悄然走进破落小院内，与那名叫袁生的男子幽会。 宋慈、刘皓及楼员外赶到，男人已倒地身亡。众惊。宋慈从容讲出此案的微妙内情。有人密谋“李代桃僵”之计：梁雨生与小姐隔楼遥望而生情，将情诗交学生宝儿送给小姐，宝儿给了丫环，丫环则给了袁生，袁又另抄一份当作己作送给小姐。小姐爱袁生风流潇洒，以身相许。袁生与她相约于订亲夜外逃。订亲之夜，梁雨生喝了许多酒，见小姐的留条，便毫不犹豫追至后花园，懵懵懂懂被人弄至枯井之下。楼夫人说，没想到袁生会做下这种恶事。宋慈却揭出楼夫人的险恶用意：借袁生之手，将小姐害死，另将梁雨生作为替死鬼，最后再弄死袁生。