贡布用管家的姓名换回了陈佩雄的自由，但是将他带到寺庙交给静安，要他读经苦修。 在汉僧的教唆下，陈佩雄又回到贡布府。贡布要他夹着尾巴作人，赔给格桑骡马，向尼玛认罪，其实他的心里还是贼心不死。 木石罗依然沉沦在感情的苦恼之中，失手打了阿撒咪，结果闹得不可开交。木石罗郁闷的一个人去喝闷酒，结果酒醉而归，给给和阿崩代劝阿撒咪借此机会生米煮成熟饭，阿撒咪想起格桑也曾替她出主意，给木石罗生个孩子，拴住他的心，于是…… 醒来的木石罗得知自己对阿撒咪行过夫妻之事，后悔万分。 花依无法解脱痛苦想要出家为尼，被芭拉及时劝阻。花依在芭拉的开导下，决定帮助木石罗，她决定嫁给格桑，只要格桑答应她的三个条件“第一，从此以后，你不能再和木石罗作对，和木家的怨恨必须一笔了清。第二，你要选木石罗作马帮大首领，不和他做对。第三，要在拉萨举办最豪华的婚礼，而且要请木石罗和他的夫人阿撒咪参加。”格桑悉数答应

婚礼上，木石罗最终给格桑献上洁白的哈达。落座之后，他就一个人郁闷的喝着酒，花依失望的看着这个她依然深爱的男人，望着这个懦弱的男人，爱憎交加，用鞭子抽打着木石罗，木石罗满腹委屈，任凭花依抽打。 格桑看出来花依依然深爱着木石罗，自己决定放弃幸福，任随花依而去。 尼玛让木石罗不要再为感情烦恼，马上就要与国民政府在昌都商议运输抗日运输的事情，木石罗作为抗日运输马帮的大首领应该以国家安危为重，木石罗和尼玛紧紧地站在了一起。 为了弥补自己内心的歉疚，尼玛向芭拉提出带花依一起回昌都老家居住，被芭拉拒绝。 花依为了寻找自己的亲生母亲，执意要前往昌都，芭拉只好随行。 贡布、尼玛、木石罗一行浩浩荡荡去往昌都，花依和芭拉也加入他们的队伍。 为了阻止各民族马帮运送抗日物资，挑起民族冲突。静安秘密唆使七指狼化装成国民政府军人模样去破坏昌都会议。 昌都草原，噶伦贡布和拉萨商会代表，滇川藏联合马帮大首领，正与国民政府商议利用茶马古道运送抗日物资的细节，七指狼带着土匪穿着国民党军服包围会场，枪声四起，一片混乱…… 激战中，芭拉为了救尼玛，用自己的身体挡住了射向尼玛的子弹，倒在血泊中。在最后关头，花依扑过来，尼玛说出眼前的芭拉就是花依的亲阿妈。花依难以接受这事实，她千辛万苦找寻的阿妈一直在她身边，而相认之时竟也是诀别之时。 噶伦贡布和拉萨商人与国民政府官员冲突，认为他们一边协商运货，一边派兵冲击会场。紧要关头，木石罗揭穿了是七指狼一伙土匪化妆袭击会场，避免了一场民族冲突。 澜沧江边水葬芭拉之后，尼玛向花依讲起往事，可花依怎能接受这痛苦的事实，她顺着江水追赶着放着芭拉的竹排。

木石罗一行回到拉萨，听说了事件经过的杨金鹏怒火中天，他没想到二十年前被杨家赶出的二姨太阿月竟是尼玛的情人，花依的亲生母亲。杨金鹏提着大刀来找尼玛次仁算帐。尼玛在杨金鹏面前承认了一切，他只希望失踪的花依平安无恙，可是尼玛夫人阿密纳却含泪站在自己的丈夫面前…… 眼看着抗日运输联合大马帮就要上路，陈佩雄不甘心失去机会，前来找静安指路，静安暗示陈佩雄最后作一次大动作阻止马帮上路。 深夜，云南会馆突然着起熊熊大火。无情的烈焰吞噬了阿撒咪和会馆主事刘老板的生命。 废墟里发现了格桑的打火石，众人认定纵火者是格桑。格桑昨夜与陈佩雄喝得烂醉如泥，现在还不知道发生了什么。尼玛率人在江边绑了格桑就在众人要处决格桑的时候，是木石罗发现破绽，找出真正的凶手是陈佩雄。而此时的陈佩雄早已不知去向。 走投无路的陈佩雄来找静安，静安漏出真面目，原来他是披着袈裟的日本特务，当他道出前来拉萨的阴谋时，陈佩雄惊出一身冷汗…… 为了保证木家马帮和格桑家马帮一路平安合作，尼玛依然拿起当年江孜大战的老枪，告别自己的纳西族妻子阿密纳和联合马帮一起踏上茶马古道。

雄伟的布达拉宫前，联合抗日运输大马帮出发为前线运送抗日物资，各民族马帮浩浩荡荡踏上征程。 静安决定利用七指狼把联合大马帮消灭在路上。 疲惫花依的花依在烈珠喇嘛的保护下，遇见了白玛活佛，才得知阿撒咪已经在烈火中往生了，木石罗在前方等着她…… 白玛寺中，烈珠喇嘛――38年前江孜大战中，十八勇士惟一的幸存者苏达，终于向白玛活佛说起三十八年前江孜大战的真相，十八勇士是被木更的随从克里巴木出卖全军覆没，而苏达却错杀了木更。活佛告诉苏达是该解开一切仇恨的时刻了。 拉萨，陈佩雄悄悄潜回贡布府，对贡布说出静安是日本特务的真相。贡布给他最后一次将功补过的机会，命他追上抗日联合大马帮，揭穿日本特务静安的阴谋。 行进的联合大马帮在沿途中发现所经之处的水源都被人下了毒。木石罗决定由格桑带领护卫队先行消灭土匪。追了很久没有见到土匪的踪影，格桑和护卫队误入原始森林，木石罗带人寻找格桑，却意外的遇见了花依。 草原深夜的篝火边，杨金鹏让侄女花依去与父亲尼玛相认，当自己养育了十多年的侄女花依与尼玛坐在一起时，善良政治的白族商人杨金鹏老泪长流。 木石罗和尼玛推断土匪应该在他们的身后，所有马帮扎营准备伏击土匪。 陈佩雄追赶大马帮的路上碰上七指狼一伙土匪，为了逃生陈佩雄去救烈珠喇嘛，烈珠让他赶快走……

山坡上白玛活佛出现了，他要阻止眼前的杀戮，让七指狼放下屠刀，七指狼疯狂不听劝阻。 陈佩雄赶上大马帮，告诉他们土匪在他们身后，只要放狼烟，七指狼就会出现，格桑不愿意再相信他的话，而木石罗却想给他最后一次机会。 马帮放起了狼烟，将七指狼的土匪队伍引入伏击圈一举消灭。七指狼临死将刀刺进陈佩雄的胸膛。而花依在木石罗的帮助下手刃了七指狼。 陈佩雄临终前让木石罗告诉噶伦贡布，他的干儿子没有做卖国贼。 看见七指狼已经全军覆没，静安悄然离去，逃往白玛寺。 最后的敌人只有静安了，在寺院中不能刀兵相见，又怕打草惊蛇，尼玛决定独自前往，引蛇出洞。临行前，花依终于开口对尼玛叫出“阿爸！”尼玛欣慰的转身离去。 藏经楼上，尼玛独会静安。静安说出来自己38年来的经历和目的，并偷偷在尼玛的茶碗中下毒。 静安以为大功告成逃出寺院，没想到在寺外被木石罗、格桑、花依、杨金鹏、给给、阿崩代所包围，更没有想到的是尼玛没有死……众人一起处决了克里巴木这个叛徒。