黄永青、郭忠良一行人等顺利抵达重庆，徐雅兰也回到了文为均身边，此时的她已经对文为均有了感情，文为均对她却只有愧疚之情丝毫没有爱慕之意，而黄永青此时满脑子想得却是生死未卜的林琴，她对林琴已悄然生情，对于郭忠良新截获的日军密码却无心破译。
日军轰炸机对重庆展开了毁灭性的轰炸，连最高军事统帅蒋介石的安全也受到了威胁。军委会张诚将军对于日军的轰炸极为震怒，他意识到密码的破译工作越来越重要，因此他以军委会的名义发出了命令，将国民政府所有的密电机构统一合并进军委会密电所，文为均任所长，黄永青任秘书长兼破译组组长，郭忠良则成为了破译组副组长。
密电所重新组建，各方势力也派出了自己的亲信，毛祖合作为委员长的亲信出任第一副所长，而调查局厉主任也派出自己的亲信，汪伪叛将韦国平进入，成为了密电所副所长，此时的文为均已经意识到，他只不过是个“空壳”，他已被毛祖和与韦国平架空。
文为均几次为徐亚兰介绍军内的少壮派军官都被拒绝，面对感情，二人再度陷入尴尬。厉峰约见徐雅兰，告诉她计划改变，要她努力让文为均爱上自己，并成为文太太。厉峰威胁徐雅兰，如果她不这么做，他就将她的身份告诉文为均。想到让文为均会因为此事终生鄙视自己，百感交集的徐雅心绪难平。
毛祖和带来了消失已久的林平，她成为了黄永青的机要秘书。黄永青对这个救命恩人早已有了好感，但此时的林琴却一反常态，对黄永青越发冷淡，对于她的反常，百思不解的黄永青陷入了痛苦，对她的感情更加执着。