杨昌浚来到台湾，并带来二十多名精通造枪、验枪、改枪的工匠。刘铭传刚要道谢，杨昌浚却苦笑着说此前答应每年给台湾四十四万两的协饷，不能给了，也不敢给了。

内务府打着为太后修建园子曾多次向杨昌浚索要银子未果，不料要资助台湾银子露了底，慈禧对此事很不满，出于多种考虑，杨昌浚再不敢给台湾协饷了。

沈应奎却认为，慈禧也未必就真的敢笑纳四十多万两银子，一番话让难过的刘铭传茅塞顿开。

慈禧听说杨昌浚要向她报效四十多万两银子，知道杨昌浚和刘铭传捏合一起来哄她高兴只好顺水推舟，将其赐予台湾。但对杨昌浚却落了个“罚俸一年”的处分。

发现掉进陷阱的毕乃尔，马莱诗媛以为又是法军，就将其关在圈养野兽的站笼里。刘朝带得知此讯马上赶来。因口气骄横。惹脑马莱诗媛，中了圈套，也被关进站笼。

刘铭传急忙赶来，受到番民的欢迎。刘铭传答应送给他们二十只火枪，并留下毕乃尔和刘朝代教习他们使用火枪。

李彤恩却忧虑他的藩社之行留下的隐患，刘铭传拿出朝廷要裁撤兵勇丁夫的抄件。为了台湾的长治久安，也为了警惕日本的虎视眈眈，他们必须藏兵与民，化民为兵。李彤恩这才明白刘铭传藩社之行的真实目的。

马莱诗媛被刘朝带挖苦，于是在前来招收学生的吴九溪面前，羞辱刘朝带。刘朝带一气之下离开番社。

见他私自跑回，刘铭传很生气。马莱诗媛赶来，刘铭传故意和马莱诗媛唱双簧，用言语激将在门后偷听的刘朝带。当她因感到委屈而哭泣时，刘朝带冲动地冲出来，好言相慰，两人拥抱在一起。

毕乃尔给驻军讲授当今天下的军事观念。曹志忠等将领，认为法国人是败军之将，不配给他们讲课，毕乃尔受辱，拔剑决斗。刘铭传以中法之战敌我伤亡悬殊为例，对曹志忠等人一顿训斥。

沈应奎从刘朝带的婚事，谈及番汉和亲，认为太后要知道毕乃尔也归化大清，对台湾的一切，都会另眼相看，但刘铭传不想因此而利用朋友。

毕乃尔主动跟刘铭传诉说自己对铁匠营弟兄的感情及对大清的情结。

太后大喜，认为这是以夏变夷的极好例证，不但准奏还任命毕乃尔为陆军教习。

仓信敦提出愿意介绍日本工程师参与铁路建设，刘铭传婉言拒绝。 张厚因为台湾铁路不让日本人插手，有气又恨，决定为这条铁路的修建制造事端。

铁路就要进入藩社了，刘淑婷担心会引起士兵和番民的摩擦。她让番学堂的教习吴九溪来到铁路工地协调。果然在张厚的煽动下大批番民，手里各执武器，涌向工地。

黑鹿正要手起刀落，濂花勇高喝“住手”，但黑鹿部落坚持要用人头祭祖，刘铭传称明日自有人头可取，将事情暂且拖延下来。

夜晚，当陈展如确认刘铭传要自献人头时，悲痛欲绝，第二天一早，夫妻俩挥泪诀别。

黑鹿被刘铭传的气概所震，危机终于化解。

日本人不甘失败，又暗杀了濂花勇部落的族人，并嫁祸于刘朝带，一场更大的冲突爆发在际。

危机时刻，吴九溪向刘铭传透露了真相，在刘朝带就要被焚偿命的关头，刘铭传终于抓获真凶，揭露了真相。

为了彻底化解番汉之间的误解，刘铭传决定让刘朝带弃籍入番，和马莱诗媛结亲。这意味着刘朝带将永远放弃功名和前程。刘朝带虽然心中犹豫，但还是勉强答应了。

看着身边的亲人一个一个为了台湾而做出牺牲，陈展如抱怨刘铭传是“离亲判众”。

刘铭传亲自送刘朝带到藩社。路上，刘朝带希望刘铭传成全李彤恩和刘淑婷。

番汉冲突解决后，铁路继续修建，但马上出现了经费短缺的问题，刘铭传托李鸿章保举沈应奎做台湾藩司，以求在经费问题上摆脱掣肘，李鸿章却另有打算，保举了邵友濂。

邵友濂到台后一味强调民间捐输，而死死管住府库银子。刘铭传只得冒险清赋，李彤恩主动要求主持清赋，以图在出现风波时可以保全刘铭传，刘淑婷对此深感忧虑，责备父亲这是把李彤恩往火坑里推。

日本人破坏铁路建设的阴谋一次次破产后，其潜伏在台湾的最高长官直接与刘璈相勾结。谋划搬倒刘铭传。

刘浤买通李家五房的管家，要在清赋的事情上兴风作浪。

李家五房管家将田册底账放到李彤恩房门外，使他发现底账与明账严重不符。李彤恩要求彻查五房帐目，李家五奶奶以自杀相抗。李家族人到巡抚衙门请愿，要求严惩逼出人命的李彤恩。刘铭传只好先让他回避，并准备在刘璈发难的时候独自承担责任。不料，在刘璈和士绅们面前，李彤恩把责任揽了过去，招致革职处分。刘淑婷因此对刘铭传大为不满。刘铭传对李彤恩此举痛心疾首，因为本来是希望他将来做自己的替手，这样一来希望落空，李彤恩却说自己本来就不可能做刘铭传的替手，因为自己是李鸿章的卧底，刘铭传对此十分意外。

铁路要经过霆字营墓地，孙开华率所部兵马守卫墓地，刘铭传劝说无效，兵变一触即发，刘铭传在新墓地先为自己造了坟墓，孙开华终于被感动，同意为弟兄们迁坟。

为解决铁路经费，刘铭传说服邵友濂，招民间资金参股，为防止刘璈参劾，他们在请奏折子里故意将招民股，说成招洋股。

请奏的折子，参劾的折子，都到了朝堂之上，顿时引起一片议论。

朝廷重臣们既反对刘铭传招洋股修铁路的请求，又认为刘璈没搞清怎么回事，就胡乱参劾，对刘铭传有失公道，于是采取了折中的处理，准刘铭传招民股。

台湾民众踊跃认购铁路股份，但邵友濂林维源发现，在民股中隐藏着大量日本人的资金，刘铭传马上决定停招民股，以防日本人控制台湾铁路股权。为引出日本人的资金，刘铭传制造准备招洋股的假象，但日本人始终没有反映。

刘淑婷意外发现英国人贿赂刘铭传的银票，震惊中她和李彤恩将此事向刘璈告发，刘璈立刻上折参劾，朝廷下旨让刘铭传居家反省，招股一事改由刘璈与邵友濂主持。日本人认为此时控股台湾铁路已经万无一失，大规模调动资金。邵友濂却突然告诉刘璈，这一切都是刘铭传和朝廷演的戏，目的就是引出日本人的资金，现在目的达到了，一切还由刘铭传主持，刘璈为自己被耍大为恼火。