空军一号上的一名海军上尉在和总统共进晚餐之后突然中毒身亡。海军罪案调查处（NCIS）的盖布斯奉命来调查死因，和特勤处总统的保镖凯特·托德合作。FBI、CIA等机构在空军一号上各执一词，混乱不堪，盖布斯带着他的得力助手托尼、马拉德医生趁乱抢得先机，开始全面调查。在调查过程中发现，根本不会凶手有机会在总统的食物里下毒，所以死去的上尉很可能早就中了毒。正当事情一筹莫展，大家互相猜疑的时候，又有一名海军上尉在自己的车里死去，他还有一个身份是凯特·托德的男友……