义经因讨伐平家有功，获得天皇大力赏赐，并决定再给义经升官，但此时义经想到以前天皇要给自己封官时，兄长赖朝极为不满，因此有很大顾虑。返回京都后，义经带着夺回的两件神器晋见天皇。然而最大的烦恼，是回到家以后，得知自己的妻子阿萌和静已经相处很长一段时间了。此时义经收到赖朝的来信，信中对义经接受这次封官表示理解和赞同，让义经喜出望外。

另一方面，赖朝派去跟随义经打仗的梶原景时(中尾彬饰)回来了，景时向赖朝报告义经打仗时的所有经过，并指出义经作战时独断独行，根本不会听从其他将领的意见。此时赖朝得知义经把夺回的神奇还给了天皇，而赖朝认为如今源家已经算是和天皇一方对立，神器回归就意味着天皇的强盛，己方则会受到严重的影响，因此对义经此举大感愤怒，并命令景时等人不要再跟随义经。得知这一消息的义经大受打击，更不明白赖朝为什么对自己生气。

义经接受朝廷封赏的行为，遭到来自梶原景时等武士的猛烈抨击，他们认为义经不应该太过于与接受来自政敌的好意。德子拜访义经时告诉他，最近武士之间到处流传义经和赖朝不和的谣言。义经于是专程派人送信到镰仓，向赖朝表示，对于这次的事情，自己的行为过于轻率，但无论如何，自己对赖朝的不二忠心是从来没有改变过的。

某天源行家拜访义经，并对赖朝大加指责，表示愿意帮助义经打倒赖朝，转而支持义经，被义经以不希望再出现一次源家同族相争的悲剧为由拒绝。

镰仓方面，大姬因丈夫义高被斩首而伤心病倒，让其母政子感到非常心痛，某次为义高上坟的时候，政子遇到了千岛，千岛告诉政子，希望义经来给义高献花，于是政子决定想办法把义经叫来镰仓。

恰巧天皇想派人把平宗盛父子押解到镰仓去，于是找义经商量该派谁去，义经认为这是去见赖朝澄清误会的绝佳机会，于是自动请缨要求护送平宗盛父子。

义经等人没有得到赖朝的许可进入镰仓，只好停留在了腰越。赖朝始终不肯联络义经，让以牟庆为首的一群人因这种冷淡的待遇日益不满。

此时已经到达镰仓的平宗盛及其子清宗见到了赖朝，被逼问唯一下落不明的三件神器中的宝剑的下落，言谈之间，宗盛发现赖朝并非大将之才，感到很失望。

另一方面，赖朝的妻子政子，为了让女儿大姬见到义经，开始秘密筹谋安排义经进入镰仓。而义经得知大姬现在抑郁成疾，也很想见见她，但却不想违背赖朝的意思擅自行动，于是拒绝了政子的要求，政子为此大为恼怒。

觉得义经对自己兄长过于愚忠，牟庆进言表示希望义经面对现实，义经因此大发雷霆，牟庆也因此很不满，向义经提出离开的请求，深刻感受到主从之间产生莫大危机的义经，体会到自己和牟庆以及一帮忠心随从之间深刻的羁绊，于是写了一封信给赖朝，这就是日本历史上著名的“腰越状”。

义经派人送信给赖朝后，一直耐心等候回音，可惜却如同石沉大海，赖朝方面一直没有任何表示。然而实际上此时镰仓方面正为这封书简议论纷纷，政子劝赖朝让义经到镰仓来，却遭到赖朝坚决拒绝。

按耐不住的义经众随从想到镰仓一探虚实，好知道赖朝等人的反应，被义经阻止，不过义经却也有了新的决定。

另一方面，赖朝虽然宣称自己绝对不会看义经的来信，实际上却对这封信非常在意，无法决定究竟要不要看其中的内容。广元则劝他看看，并告诉他其中内容非常深重，让赖朝更加烦恼。

几天后，北条时政到腰越拜访了义经，帮赖朝传话给义经，命他们护送平宗盛父子返回京都，得知见赖朝无望，义经感到非常伤心难过。

义经一行人终于得到允许进入镰仓地界，但却始终未得到允许和兄长赖朝见面，直接就被明令护送平宗盛、清宗父子返京。于是，义经开始对赖朝产生怀疑。

而赖朝则担心义经和宗盛联合起来反对自己，于是开始筹谋如何削减义经的势力。

回京途中路经一家寺院，听闻几天前平重衡也在此地屹立良久，义经和宗盛于是开始一起回忆过去的美好时光。

而此时重衡已因为承认了火烧东大寺和兴福寺的罪行，即将被处决。自知时日无所得重衡告诫来探望自己的妻子辅子，希望她不要追随自己而去，要努力活下去，并给妻子一段自己的头发。

另一方面，义经宗盛等人回到京都的第二天，宗盛告诉义经，如果得到允许，决定出家为僧，为平家过去的罪孽赎罪。此时镰仓方面派来的使者安达盛长(草见润平饰)正巧到达京都，他传达了赖朝的命令，要求已经处决平宗盛父子。义经对此大表反对，他认为平宗盛等人已经没有任何谋反之心，应该给他们留一条活路，可惜盛长一句话都听不进去，让义经左右为难，最后终于下定了决心，毅然拒绝了赖朝的命令。

满怀伤感却也有着觉悟以后要与赖朝为敌的义经，得到后白河法皇的文言安慰。法皇同时暗自窃喜，一定要取得义经这一对抗源赖朝的有力武器。

此时安达盛长回到镰仓，把义经的近况悉数报告给了赖朝，来找深恐义经被法皇利用，大感恐慌。

义经向静倾诉自己的烦恼，和哥哥赖朝的关系空难再修复，自己现在下定决心要和赖朝走不同的路，希望靠自己的力量建立新的国家。

京都发生大地震，人们生活在水声火热之中，这让义经非常难过，他飞奔在街道上，混乱之中听到人民的纷纷议论，大家都在大声批判现在的局势和朝政，但对义经的评价却相当高。

某天空惠来找义经，告诉他自己在地震中失去了住所，于是义经劝空惠留在自己家，但空惠拒绝了义经的好意，并告诉他要凭自己的力量活下去。

法皇任命把伊予国赏赐给义经，并封他为伊予守。牟庆等人担心赖朝不会同意，义经则认为这样是显示自己的决心，接受了这项任命。得知此事的赖朝大发雷霆，派尾原景时进京刺探义经和法皇的动向。

而此时的义经则被源行家等人逼迫，答应了“打倒赖朝”的行动。

得知此消息的赖朝，于是决定“讨伐义经”。