海兰弼不顾周铁鹪等人的阻拦，执意要用火药炮轰孤岛，将此处夷为平地，全然不管福康安的死活。千钧一发之际，太监总管携口谕前来，仅有四字“止戈相安”，意思已经很明确，可是海兰弼依旧无视圣意，正当他下令开炮，好在福康安及时现身。
在此之前，福康安希望能带两个孩子回府，奈何平平、安安不愿离开，执意要留在胡斐身边。福康安自知有愧，也便没有强求，本想将乾隆亲笔手谕交给胡斐，当作是他的免死金牌。
然而胡斐表示江湖儿女，所守者道义、忠义乃至名节，倘若乾隆当真是信守承诺，又何必在乎这一纸手谕。也正因胡斐的侠肝义胆，使得福康安为之敬佩，命令所有守卫退回京城，不可再追击胡斐他们。
如今掌门人大会结束，一切尘埃落定，袁紫衣落发为尼跟随师父回到天山派，临走前将昙花玉牌送给程灵素，希望她能够陪在胡斐身边。胡斐也没有挽留袁紫衣，而是愿她晨钟暮鼓，功德圆满，从此二人彻底陌路，尘缘了断。
胡斐和程灵素见过南兰母女，并且在苗人凤灵位前深深叩拜之后，结伴前往药王谷小住，那段时间彼此渡过短暂又美好的时光。奈何石万嗔始终不忘药王神篇，带着薛鹊和慕容景岳偷袭胡斐，导致他中毒失去意识。
程灵素急忙给胡斐服用解药，叮嘱他运功调息，谨记初见时的约法三章。石万嗔自然是不会让程灵素为胡斐争取时间，可是程灵素突然提出交易，自己愿意交上药王神篇，他们也得彻底离开药王谷，从此不可露面。
为了证实自己手里的药王神篇乃是真作，程灵素故意说起碧蚕毒蛊里石万嗔不曾知晓的秘密。因为无嗔和石万嗔都是使毒的大行家，双方所使药物之烈，毒物之奇，二人数次斗法，每次都是石万嗔屈居下风，若不是无嗔大师始终念着同门之谊，早已取了他的性命。
所以程灵素透露可有法子令碧蚕毒粉不显，石万嗔果然信以为真，便立马在慕容景岳的手心里尝试。程灵素看到石万嗔中计，继续指点他以孔雀胆和鹤顶红隐去青绿之色，果然效果相当显著，可是三种毒物混合成为无药可解的奇毒。
慕容景岳为人极无骨气，为能保命不惜跪求程灵素救自己，薛鹊也连忙附和，实则趁她不备冲去抢夺药王神篇，并且将匕首抵着程灵素的脖子。胡斐运功调息片刻隐约有所好转，当他察觉到程灵素处境危险，毫不犹豫地出手反杀慕容景岳和薛鹊。
石万嗔被胡斐弄瞎双眼，逃走之前划伤胡斐手腕，导致他身中三种奇毒，犹如千万只蚂蚊同时在咬啮心脏。胡斐早已是做好必死准备，面对程灵素流泪模样，心头涌上许多往事，感慨自己在药王谷才是最快乐的日子，也多么希望能够和她永远在这里。
可惜话还没说完，胡斐感觉全身发麻，语言模糊不清，整个人瘫倒在地，只能眼睁睁地看着程灵素似是下定决心般，从柜子里取出七心海棠和蜡烛，紧接将口就上伤口，用力吸出毒素。待毒素吸尽后，程灵素已是虚弱不堪，缓缓倒在胡斐怀里，表示很想看到长满胡子的样子，可惜已经等不到那个时候。
自从程灵素死后，胡斐亲手杀死石万嗔，又将程灵素埋葬在雪洞里，每逢父母、苗人凤以及程灵素的忌日，他都会亲自前往祭拜。时光流逝过了几年，南兰也会带着女儿过来，胡斐蓄起胡子坐在程灵素的墓碑旁边，看着不远处的点点烛光，心中思潮起伏，瞬间想起许许多多事情。
程灵素的一言一语，一颦一笑，当时漫不在意，此刻追忆起来，其中所含的柔情蜜意，才清清楚楚的显现出来。苗若兰年纪虽然不大，却已看出胡斐在思念程灵素，胡斐向若兰讲述起韦陀菩萨和昙花的故事，声音悠悠掀起无尽涟漪。