阿衡之死令黄药师伤心欲绝，遂决定与阿衡一同离开桃花岛，周伯通见状，笑谑黄药师与阿衡一同寻死，更说出郭靖早已背熟九阴真经，黄药师闻言大怒。原来黄药师发誓，凡懂九阴真经者死，因而往杀郭靖，郭靖不知情，大感莫名其妙，后周伯通将经书撕毁，终冰释干戈，但黄药师不许黄蓉跟随郭靖等人离开桃花岛。黄蓉思念郭靖，遂毅然向黄药师辞行，却见黄药师与阿衡同在冰牢内，黄药师已一头白发，而母亲已死去。

七公、伯通与郭靖乘药师所造之船离开桃花岛，岂料船本为药师用作与阿衡合葬之用，船身只用浆糊并合，三人不知情，船离岸后，海水迅即涌入船中，船不久沉没，此时欧阳锋与欧阳克之船经过，欧阳锋为得经书，将三人救上船。欧阳锋哄骗伯通背诵经文，伯通不肯，跳入海中，欧阳锋唯有转移对付郭靖。欧阳锋知悉七公好美食，遂以美肴诱之，七公果然中计，身中剧毒。

七公因剧毒未除，又因被西毒重击一掌，武功一时难以复原，恐不能再保护黄蓉，遂劝黄蓉及早离开荒岛，但小艇不知所踪，黄蓉无法离去。七公自知不久人世，遂立黄蓉为丐帮帮主，并传授打狗棒法。欧阳克被大石压伤，痛极晕倒，此时郭靖与欧阳锋同时到达荒岛，欧阳锋见侄儿境况，即要挟黄蓉等人救他。黄药师到处访寻女儿踪影，在望江楼遇上周伯通，两人追逐至悬崖，伯通戏称黄蓉已葬身大海，黄药师信以为真，悲恸不已，耸身跳下山崖。

周伯通将欧阳克擒获交给黄蓉等人。七公剧毒未除，须往长白山采千年人参医治，而欧阳锋为医治侄儿双足，亦兼程往长白山。梅超风负伤来到念慈所居村中，念慈对她深恶痛绝，欲趁她受伤将之杀死，但见超风替怀中小孩包扎伤处，感她仍有良知，遂将她扶返家中疗伤，超风被念慈感动，深悔从前所作一切。梅超风功力恢复，强要念慈一同往找杨康，适杨康与西毒等人从长白山赶返。

杨康深爱念慈，但念慈声言恩断义绝，而完颜洪烈亦反对二人婚事，杨康为娶得念慈，向完颜洪烈诈称抛弃皇宫生活，望与念慈双宿双栖，洪烈只好任由杨康自作主张，但不许他带念慈返燕京。翌日，杨康即带同媒人到来迎娶念慈，念慈仿如置身梦境，不禁喜极而泣。欧阳锋错练九阴真经，以致神智错乱，脾性越坏，多次滥杀无辜，洪烈感不满，欧阳克无奈带之返白驼山休养。

七公一直欲吃得皇宫珍馐百味，黄蓉为使七公心愿能偿，遂与各人一同上路往皇宫；行至牛家村一破落酒帘外，屡被区姑戏弄，黄蓉发觉区姑谙桃花岛武功，甚感疑惑。黄蓉在酒帘柜内发现一神秘洞穴，遂与郭靖等进内查探，赫然见师兄曲灵风等数人伏尸一铁箱上，令各人更感扑朔迷离。