七公到御厨偷吃食物，伯通恐防七公有意外，四出找寻，途中遇见沙通天等三人，伯通将三人制服，并命三人吞下药丸，并诈称是毒丸，三人信以为真，服从伯通命令以便得到解药，伯通遂命三人到皇宫找七公。沙通天等在皇宫与士兵起争执，七公乘乱逃去，伯通见沙通天等人找不着七公，大为气恼，七公随即现身，岂料伯通无意吐出真相。

柯镇恶与郭靖一直误会黄药师杀死五怪，对药师恨之入骨，黄蓉为查得真凶，将柯镇恶捉去，欲问个明白，但郭靖误会黄蓉对柯不利，怒斥黄蓉，柯镇恶趁黄蓉不觉将她击晕，打算于八月十五到烟雨楼找药师报仇时以黄蓉作人质。郭靖不想黄蓉被牵连，请七公与伯通救走黄蓉，但郭靖坚决要杀药师报仇，黄蓉无法阻止。杨康与欧阳锋等在烟楼满布五彩毒灯笼，想在全真六子与药师交手时坐收渔人之利。

欧阳锋与杨康等人带傻姑到古庙，黄蓉、柯镇恶藏身神像后，黄蓉为探出杀五怪真凶，故意现身，向欧阳锋诈称药师请他相助，并以九阴真经经文作报酬，欧阳锋信以为真，未对黄蓉不利，黄蓉借机向傻姑查问当晚五怪被杀经过。原来当日六怪拜访药师，药师无意理会，命傻姑招呼各人，药师则独自划艇出海垂钓，傻姑到海边找寻药师，却见欧阳锋与杨康到来，杨康诱骗傻姑引六怪到墓穴，欧阳锋假扮药师将五怪杀死，故意放走柯镇恶。

郭靖遇见柯镇恶，柯镇恶将事情经过一一告知，郭靖请柯镇恶往桃花岛找药师救黄蓉。郭靖念及与杨康结义之情，到古庙料理杨康之身后事，见杨康尚有气息，忙替之疗伤，但康自知命不久矣，让郭靖找念慈到来见最后一面。念慈见康垂死状，悲痛万分，杨康欲改过自新已感太迟，很快毒发身亡，念慈与郭靖含泪将他埋葬。洪烈闻悉康已死，自感罪孽深重，随后蒙古大军攻金，洪烈无心理会，蒙古兵长驱直进，势如破竹。

金帝见情势危急，愿以皇位吸引洪烈起兵反攻，洪烈即召集兵马，一时军心大振，铁木真亦不敢轻视。铁木真命术赤修筑城墙防御，郭靖眼见百姓妻离子散，大为不忍，遂亲自向铁木真求情，但术赤认为军令如山，不得更改，令铁木真左右为难，正在争执之际，裘千仞突行刺铁木真，郭靖忙加掩护，但裘千仞武功厉害，众人均不是对手，郭靖即换去铁木真之衣饰，假扮铁木真引裘千仞离去，裘千仞追出，发觉是郭靖，狠下毒手。

郭靖屡受铁木真之恩德，愿随大军西征，铁木真封郭靖为那颜大将军，统率万人军队。鲁长老等带一千弟子加入丐帮。铁木真于誓师宴上欲选出大汗继承人，术赤与察合台勾心斗角，大汗虽知两人善于用兵，窝阔台平日待人宽厚，遂选他为继承人，术赤与察合台深深不忿，宴后比武，郭靖替两人排解，但两人随即带精兵到大草原决战。