施琅带清兵追上通吃岛，陈近南等人把清兵打得落荒而逃，陈近南劝施琅回台湾，引起郑克爽的不满，被郑克爽偷袭身亡。 韦小宝答应师傅陈近南不杀郑克爽，但要逼郑克爽写下巨额欠条。郑克爽为了保命只好以阿珂做抵押给韦小宝，并告知韦小宝，阿珂肚子里怀的是他的孩子，韦小宝只好放走郑克爽和冯锡范，却被风际中拦住。风际中向韦小宝说明身份，韦小宝万没有想到风际中竟是皇上派到天地会中的奸细，风际中威胁韦小宝却被双儿一枪打死。 韦小宝安葬了师傅陈近南，带着七个老婆来到通吃岛上的一个山洞居住。

大臣们在朝上对炮轰伯爵府之事议论纷纷，康熙心中不快，让阿济赤向大臣们说清楚炮轰伯爵府之事。 通吃岛山洞里，韦小宝和老婆们嬉戏，其乐融融。建宁公主仍不忘和其它人争风吃醋，施计骗取小宝，教双儿给韦小宝请安，让韦小宝想起当年“火烧藤甲兵”的事情，撒腿就跑，建宁挺着大肚子在后面追。阿珂总看不惯这些，远离他们，一人跑在山顶痛哭，韦小宝独爱阿珂，自己专为阿珂的孩子做了一双鞋送给阿珂，终于逗笑了她，也渐渐地夺回了阿珂的心。韦小宝对阿珂的宠爱让建宁心中不平，老是遭到韦小宝的冷眼讽刺。 康熙思念韦小宝派赵良栋和王进宝带密旨各岛寻找……到了通吃岛就大声喊：小玄子……韦小宝也想念康熙，以为是小玄子的鬼魂冲出洞外。

韦小宝冲出山洞才发现中了小玄子的鬼计，原来是皇上派人这样叫他，是为了引他出来。 康熙不忘韦小宝的功劳，圣旨里一件件都清清楚楚地，让韦小宝回忆起当年二人一起擒拿鳌拜的情景。康熙要让韦小宝消灭天地会，韦小宝宁愿留在通吃岛上做王八都不愿意回京，韦小宝拒绝了赵良栋和王进宝。 阿珂、苏荃及建宁公主为韦小宝生下两子一女，让韦小宝忙得不亦乐乎，掷色子给孩子取名字。康熙责骂赵良栋、王进宝，怕韦小宝再溜走，康熙仍给韦小宝加官进爵，连他的儿子韦虎头都封了云骑尉。 几年后，吴三桂被平定，郑克塽归降，康熙再次让王进宝上通吃岛给韦小宝送东西，劝说韦小宝。

韦小宝惋惜自已没有赶上平定吴三桂。在通吃岛的生活也慢慢厌倦，思念起康熙。 康熙也再次传召韦小宝回京，特意派施琅来通吃岛上请韦小宝，韦小宝也正顺着康熙给他的台阶利用施琅出岛，先去台湾绕了个弯才好回京面见皇上。 韦小宝的台湾之行，也相当顺利，不但为施琅解了燃眉之急，也得到了台湾民众的好评，更轻而易举地拿走了台湾人民的一百万两银子。在台湾也为师傅陈近南出了口气，推翻董太妃的塑像，塑上师傅陈近南的塑像陪伴国姓爷。

索额图奉皇上之命来台湾准韦小宝回京，小宝暗中大喜，小玄子还是让了他一步。原是因为韦小宝去过雅克萨，要派他去议和。 韦小宝回京时向施琅要了林兴珠和五百藤甲兵带回京城准备攻打雅克萨用。 韦小宝进京面见皇上心中有说不出的滋味，禁不住眼泪夺眶而出。康熙向小宝问了问他在台湾的所见所闻，并跟韦小宝商量如何到雅克萨议和。康熙告知韦小宝郑克爽已经投降大清，叫小宝不要为难郑克爽，韦小宝心有不甘。此时，韦小宝被封为三等鹿鼎公。韦小宝路遇已被自己杀害的多隆出现在面前，以为撞见鬼甚是害怕，听多隆讲述当天的事情才知多隆是因心长偏了没死，皇上又替他掩埋实情，韦小宝觉得过意不去，把郑克爽借自己银子的事儿委托给多隆，讨来得都是自己的。 次日，韦小宝带双儿去攻打雅克萨，凯旋而归并签下中俄尼不楚条约。康熙甚是高兴。

韦小宝向康熙讲述雅克萨之行，自制水炮攻破雅克萨城，打败罗刹鬼。 正当韦小宝封为一等鹿鼎公回府的路上，碰到茅十八当街辱骂皇上和韦小宝，被清兵擒住带回伯爵府，韦小宝良言相劝，茅十八痛骂韦小宝忘恩负义，杀害陈近南，韦小宝才得知康熙为绝后患，把杀死陈近南的罪命按在了韦小宝的头上，韦小宝要找皇上讨回公道，被康熙拒绝，康熙亲审茅十八，并下旨要韦小宝 亲自监斩茅十八，还要以韦小宝妻儿十口要胁。 韦小宝为了救茅十八，不惜逆旨，想法设计陷害冯锡范。