黄蓉带着郭靖回到了桃花岛，黄蓉怕黄药师不接受郭靖，就先行去说服她爹爹，留下郭靖一个人。郭靖误打误撞碰到了被黄药师关着的老顽童周伯通，在郭靖的帮助下，老顽童抵挡了黄药师的箫声。周伯通觉得与郭靖非常投缘，不顾世俗礼仪与郭靖结拜了兄弟，并将自己被黄药师囚禁在桃花岛上的原因原原本本地告诉了郭靖。原来当年周伯通的师兄王重阳过世后，派周伯通将九阴真经分在二个地方藏好，未曾想在藏书途中周伯通遇到了黄药师和他新婚的妻子。

当年周伯通和黄药师比武输了，把九阴真经借给黄蓉的母亲看，黄蓉的母亲凭着过目不忘的本领，将九阴真经的全文都背了下来，周伯通被骗误认为经书有假而将之毁去。几年后周伯通了解真相，去桃花岛找黄药师算帐，没想到黄蓉母亲因产后默写九阴真经而死，黄药师将黄蓉母亲之死迁怒于周伯通，将其囚禁在桃花岛至今。周伯通将在岛上领悟的空明拳和左右搏击之术交给郭靖，郭靖学习后武功大增。欧阳锋为了九阴真经，带欧阳克上桃花岛向黄药师求亲。

周伯通发觉郭靖的匕首外包着的人皮上刻着的是九阴真经，怕告诉郭靖实情他救不肯学了，就瞒着郭靖将九阴真经上的功夫偷偷教给他。洪七公跟着欧阳锋的船也来到桃花岛，三大高手聚会又比试了一番武功。黄药师认为欧阳克比郭靖聪明武功高，硬要黄蓉嫁给欧阳克，黄蓉不从。后黄药师经过黄蓉和洪七公的劝说，听从洪七公的建议让郭靖和欧阳克二人比试三场，赢两场者可做他的女婿。

今非昔比，郭靖的武功已大有长进。第一场比试武功中，最后关头郭靖使出蒙古的摔跤功夫胜了欧阳克。第二场比试音律，郭靖凭着深厚的内力抵挡了黄药师的萧声战胜了欧阳克，但是由于黄药师袒护欧阳克，判欧阳克胜。第三场背诵九阴真经，没想到郭靖早已烂熟于胸。黄药师以为是黄蓉的母亲附身于郭靖身上，而接纳了郭靖。周伯通意识到在教郭靖九阴真经的同时，自己也练成了九阴真经后，便离开了囚禁他的山洞，和郭靖、洪七公坐上黄药师准备自杀的船离开了桃花岛。

由于郭靖所坐的船是黄药师准备自杀用的，离开桃花岛没多久，船就进水沉没了，正好被跟随他们的欧阳锋的船碰上，救了他们。周伯通与欧阳锋打赌输了，不肯默写九阴真经被逼跳海。洪七公教郭靖写假的九阴真经骗欧阳锋，黄蓉为了找郭靖划船与欧阳锋船遇见了。洪七公和欧阳锋起了冲突，在打斗中因存仁慈不忍对欧阳锋下毒手而反被欧阳锋打伤，并被毒蛇咬伤，中了剧毒。大船突然起火沉没，洪七公、黄蓉和欧阳克一起流落到一个无人的荒岛上。

穆念慈来到牛家村，等待杨康报仇后回来与她完婚。完颜洪烈安排杨康接替欧阳锋在金国的所有工作。在荒岛上，欧阳锋企图对黄蓉不轨，洪七公假装武功未失，吓退了欧阳克，使得欧阳克不敢再欺负黄蓉，但同时也加重了伤势。洪七公怕自己无法活着离开荒岛，便将丐帮十九代帮主之位传给黄蓉，并教她打狗棒法。拖雷与宋朝官员商量联合攻打金国事宜，完颜洪烈却指示宋朝官员将拖雷杀死，宋朝官员怕同时得罪蒙古国和金国，把拖雷他们偷偷放了。