公孙止偷袭了耶律齐一行人，想要带走耶律完颜。正好此时大武小武两兄弟赶到，但是却根本不是公孙止的对手，好在此时武三通出现，和公孙止打斗。

正好黄蓉一行人也经过此地，还以为是杨过在与人打斗。公孙止出言挑衅，黄蓉和李莫愁同时出手和公孙止决斗。

公孙止抓走了郭芙作为人质威胁黄蓉，黄蓉心里十分着急。耶律齐出手救了郭芙，公孙止趁机逃走。黄蓉询问耶律齐是否是全真教的人，但是耶律齐并不愿意透露。黄蓉聪明过人，已经猜出耶律齐的师傅。

大武小武想要找李莫愁报杀母之仇，黄蓉建议要以大局为重。

黄蓉透露此次前来都是为了找寻过儿，众人都非常担心杨过的下落。黄蓉推断杨过此时应该在活死人墓，便决定要去终南山找他。黄蓉带领众人前往终南山，此时赵志敬也匆匆赶回全真教。

赵志敬听说此时甄志丙的接任大典马上就要开始了，便想要冲进大殿阻止。正在册封之时，赵志敬进来揭穿甄志丙当日和小龙女的苟且之事，但是鉴于丘处机的法旨在此，赵志敬不得不罢手。

杨过不愿意将郭襄还给黄蓉夫妇，算是为自己报了断臂之仇。

蒙古人到全真教给全真掌教册封玄门道场，但是甄志丙并不愿意接受。赵志敬召集了全真教的众位师兄商量如何应对，众人都不愿接受蒙古人的讨好。但是赵志敬拿出甄志丙和小龙女的事威胁甄志丙，甄志丙并没有受威胁，而是坚持要反抗蒙古到底。

甄志丙准备自尽了断所有折磨痛苦，但是赵志敬冲进来阻止了他。甄志丙将代掌教职位让给了赵志敬，赵志敬便立马投靠蒙古。 

杨过来到终南山，发现赵志敬现在掌管全真教。

甄志丙将掌教之位让给赵志敬，但是众位师兄都不愿意如此，提议等到丘处机出关之后再做定夺。众位师兄提议若是真的要让位，那也不能够让给赵志敬这个叛徒。 

甄志丙迫于无奈，不得不将位置让给赵志敬。 赵志敬成为掌教之后便立马接受了蒙古的赐封，投靠讨好蒙古。 全真教眼见赵志敬不忠不孝，便决定要废了他。蒙古人帮助赵志敬绑住了甄志丙一行人。 金轮国师商量要抓住丘处机，这样才能够制服全真教。 

蒙古人封住了丘处机闭关的洞口，试图抓住丘处机。赵志敬为了保住自己的掌教职位，想要杀了甄志丙一行人。甄志丙反抗，正在赵志敬准备杀了甄志丙之时，小龙女赶到了全真教。

小龙女想要杀了赵志敬，蒙古人想要保护他。正在小龙女和蒙古人打斗之时，赵志敬偷偷逃跑求助金轮国师。金轮国师和小龙女对阵，其他的蒙古高手也加入混战。甄志丙想要杀了赵志敬清理门户，洞内丘处机已经练成了七星聚会，便破洞而出。

霍都和丘处机对阵，全真教新练成的七星聚会威猛无比，打败了霍都。小龙女被人围攻，快要受伤之际，甄志丙以死相救，并自己撞在小龙女剑上。

杨过来到大殿，发现空无一人。全真教和蒙古高手合力对付小龙女，她身负重伤。此时杨过赶到救了她，两人久别重逢。小龙女发现杨过的左臂竟然被砍断，心疼不已。

杨过决定要带小龙女回古墓疗伤，他凭借一己之力重伤金轮国师，但是最后放过了金轮法师和达尔巴。全真教找杨过寻仇，杨过和小龙女共同面对。

全真教自觉以少欺多并不好，决定放走杨过和小龙女，此时身负重伤的甄志丙也请求师叔师伯放过小龙女二人。小龙女向杨过解释当初自己被甄志丙玷污的事实，杨过答应原谅甄志丙，甄志丙自杀谢罪。

小龙女感觉自己时日不多，不愿意日后杨过一人孤苦伶仃。杨过决定要娶小龙女过门，小龙女感动不已。杨过和小龙女决定在重阳宫成亲，并绑架了一位重阳宫师伯为见证。此时周伯通冲进来，因为他被蜜蜂攻击，便将自己罩在一个大钟里。丘处机一行人立马冲进重阳宫，救出了师伯。杨过建议小龙女使用玉峰浆来吸引更多的蜜蜂困住丘处机一行人，两人可以趁机离开。

周伯通逃出了大钟，看到之前骗自己的赵志敬，便将他装进了大钟里。周伯通责怪丘处机竟然会收赵志敬这种败坏师门的徒弟。全真教的很多徒弟都肿了蜂毒，刚好周伯通手里有一瓶玉峰浆。丘处机希望周伯通能够将玉峰浆奉献出来，但是周伯通并不愿意。争吵间周伯通不慎将玉峰浆丢到了大钟下，此时赵志敬趁机捡起来威胁周伯通。但是蜜蜂突然来袭，赵志敬受伤。

丘处机心疼自己的爱徒甄志丙，但是考虑到他之前要玷污小龙女，这样也算是将功补过。丘处机建议找到小龙女，便可以拿到更多的玉峰浆。

杨过眼见小龙女伤势如此严重，便决定要和小龙女一同回到古墓疗伤。两人商量先将小龙女运回古墓，这样便可在寒玉床上疗伤。

杨过想尽办法终于将小龙女成功运回了古墓。

杨过也带着郭襄，一起将她带回了古墓。

杨过点了蜡烛制造出成亲的浪漫气氛，小龙女感动不已。小龙女打开之前林朝英留给她的一个柜子，原来里面有之前林朝英为自己准备的嫁衣。杨过还发现了之前王重阳写给林朝英的信件，里面通篇都是写的王重阳在战场上的经历，杨过失望不已。

小龙女讲到之前林朝英被人偷袭，身受重伤，林朝英不得不在古墓疗伤。杨过悟到原来可以在寒玉床上给小龙女疗伤。此时郭襄突然哇哇大哭，杨过不得不先去将郭襄先哄睡着。

杨过替小龙女疗伤，小龙女伤势好转。

黄蓉一行人来到终南山，李莫愁并不愿意上山，便留在了山下。黄蓉上山之后听丘处机说起之前杨过和小龙女在重阳宫的种种，深感愧疚。丘处机为自己打伤了小龙女深感抱歉。 

黄蓉推断此时杨过肯定在活死人墓替小龙女疗伤，丘处机先将黄蓉引见给周伯通。周伯通看见黄蓉之后十分开心，两人寒暄一阵。

黄蓉将耶律齐引荐给周伯通，原来周伯通就是耶律齐的师傅，果真如之前黄蓉所料。丘处机建议耶律齐加入全真教，丘处机提到现在蒙古压境，所有人都当尽力抗敌。

李莫愁和黄蓉谈条件，自己可以帮黄蓉夺回女儿，但是黄蓉要帮她拿到玉女心经。

黄蓉一行人也进入了古墓。

杨过帮助小龙女疗伤，李莫愁带领黄蓉一行人进入古墓，但是却使用机关将黄蓉一行人关在了古墓隔间里。郭芙十分担心，耶律齐便安慰她。

李莫愁庆幸甩掉了黄蓉一行人，便想要找到小龙女夺回玉女心经。李莫愁的突然闯入让小龙女心神不宁，无法好好疗伤。

李莫愁使用赤练神掌伤了小龙女和杨过，杨过立马反击。李莫愁追着杨过二人不放，只等他俩剧毒发作。杨过设法将李莫愁关在了棺材里，此时小龙女毒发。

郭芙因为李莫愁的事情和大武小武吵了起来，耶律齐突然间听到郭襄的哭声。耶律齐号召众人合力推开石墙，这样便可逃出密室。郭芙看见郭襄激动不已，大家决定前去找李莫愁报仇。

杨过小龙女为了躲避李莫愁，躲到了棺材里。郭芙以为躲在棺材里的是李莫愁，便使用李莫愁的冰魄银针误伤了小龙女，杨过对此十分生气。杨过赶众人出古墓，抢走了郭襄。

李莫愁也逃出了棺材，郭芙一行人赶紧追上。蒙古兵放火烧山，郭芙突然间看见了黄蓉，便执意要去火堆里找黄蓉。没想到李莫愁在火堆里暗算了郭芙。小龙女看见之后劝杨过救出郭芙，杨过便照做。

黄蓉和郭芙汇合，在一番商量一下，众人决定先到绝情谷救出朱师兄和天竺大师。 杨过和小龙女在小木屋休息，没想到霍都也出现在这。杨过假扮猎户骗过了霍都，同时还偷听霍都和丐帮叛徒的对话，一网打尽了霍都和丐帮叛徒。

恰巧雪夜一灯大师也到访小木屋，杨过小龙女留一灯大师和徒弟慈恩在小木屋。一灯大师的徒弟慈恩心中仇恨满溢，在霍都的诱惑下动手杀了丐帮叛徒。

一灯大师想要安慰慈恩，但是他根本就听不进去，甚至还要杀了一灯大师。一灯大师并没有还手，好在杨过及时出现，救了一灯大师一命。

杨过说服慈恩前去杀了霍都，但是慈恩并不听话，反而要和杨过大打出手。但是慈恩根本就不是杨过的对手，最后在杨过的点化之下皈依佛教。

一灯大师看出杨过身中剧毒，原来他此次来中原就是要前去绝情谷替杨过找解药，而慈恩就是裘千尺的兄长。杨过介绍小龙女给一灯和慈恩，一灯大师得知小龙女受伤之后，决定帮她疗伤。

一灯大师给小龙女一颗灵丹妙药，小龙女服后神清气爽。慈恩大师要和小龙女比试轻功，一灯大师询问杨过为何内力如此深厚，杨过直言自己最近连服蛇胆。

周伯通发现了小龙女，便让小龙女坐在自己的箱子上休息。最后周伯通帮小龙女赢了慈恩，一行人来到了绝情谷门外。

裘千尺派人出来迎战，原来李莫愁和程英陆无双都在绝情谷，杨过出手救了程英和陆无双，此时黄蓉一行人也赶到。

众人合力赶走了李莫愁，陆无双和郭芙斗嘴。程英和陆无双看见杨过左手断臂之后十分心疼，在得知杨过已经和小龙女结为夫妻之后更是心碎。

裘千尺邀请众人前去绝情谷，最后杨过竟然愿意放弃绝情丹。