大家破坏了一座座黑暗塔。这天，大家来到守卫兽的地域，开始由于体力不足被迫撤退。但是一只守卫兽在小光进入之前打烂了电视，小光被迫留在数码世界。大辅与阿武决定返回数码世界救小光。巴达兽在结界外进化成天使兽，但进去后又退化了。大辅很嫉妒，硬要V仔兽进化成什么“超级天使兽”。当他们发现小光时，被邪恶环控制的安杜路兽出现。即使铁鹰兽和钢钻兽增援都不敌它。后来，安杜路兽分别认出大辅带着的太一送的太阳眼镜、太一以及小光，以前的记忆使邪恶环的力量消失。大家回去后，见到光子郎后，得知新型暴龙机名叫D3暴龙机。

大辅的足球队要与天才少年一乘寺贤的足球队比赛。上半场一乘寺贤没有来，大辅攻进一球，以1：0领先。下半场一乘寺贤出场，以超乎寻常的能力攻进9球，但最后一球被大辅奋力铲下，但铲伤了一乘寺贤的右脚。大家到了数码世界后，除大辅外所有人突然神秘消失，暴龙改造者用大辅的同伴威胁大辅，让他下跪并让V仔兽踩他的头。后来阿武他们赶到，原来那些人质是假冒的。大辅非常气愤，便单独冲上去将暴龙改造者打了下来。突然大辅注意到暴龙改造者的右脚有伤，暴龙改造者终于亮出底牌——他就是一乘寺贤！

一乘寺贤看到自己接受采访的录象，觉得很讨厌。于是他决定一直留在数码世界研究。大辅他们找到一乘寺贤家的地址，却发现他已失踪，于是立即去数码世界。他们遇到火焰兽，很辛苦终于打败了它们。但是暴龙改造者将邪恶环带在太一的暴龙兽上，并使它进行了黑暗进化！可怕的丧尸暴龙兽出现，它以压倒性力量打倒所有数码暴龙。最后丧尸暴龙兽因能量殆尽而退化成亚古兽，又被暴龙改造者带走了，太一此时心急如焚……

大家来到电脑室，小京因为恐惧被大家劝留在电脑室。同时，暴龙改造者不断让暴龙兽黑暗进化成丧尸暴龙兽，来检测邪恶环的缺点。大家打败朽木兽后得知暴龙改造者的位置。同时，暴龙改造者终于发现邪恶环的缺点，进而研制出邪恶螺旋环，此时却发现亚古兽已被他的搭档虫虫兽放走。太一等人遇到亚古兽，但在即将离开时又被暴龙改造者攻击。暴龙改造者又将邪恶螺旋环套在亚古兽身上，将其进化成全身充满病毒的蓝色的机械暴龙兽。太一由于不愿亚古兽受伤而阻止大家攻击错失良机，机械暴龙兽以其强大的攻击力打倒了数码暴龙们，此后被暴龙改造者带走……

大家继续前进追赶暴龙改造者，太一让大家要尽全力攻击机械暴龙兽。大辅不解，太一告诉他打架可以增进友情，他就更不解了。他们发现友情的装甲，于是尝试拔起来，没有人成功。突然黄蜂兽攻击他们，而且捉走巴达兽。暴龙改造者出现并想将邪恶螺旋环套在巴达兽身上，幸好加鲁鲁兽出现，救下巴达兽。众人便向机械暴龙兽展开攻击，只有大辅始终不敢攻击，烈焰兽被迫退化。最后，大辅觉醒，使友情装甲自动飞到大辅手里。V仔兽装甲进化成雷龙兽，与大辅并肩作战，终于将机械暴龙兽的邪恶螺旋环打碎，亚古兽又回到了太一身边。

巴多拉兽被飞龙兽追击，发出求救信号，小空收到求救信号后立即用电子邮件通知其他人。但阿武正在睡觉而小光和迪路兽去散步，没有收到。于是小空与其他人一起去数码世界。他们在西部镇遇到自称正义守护者的五角星兽，后来却发现它其实戴了邪恶环。所有人都被它捉住，他们发现比丘兽也被捉住了。趁五角星兽出去时，也自称正义使者的左轮兽出现，但被大家怀疑也戴了邪恶环。证实了它没被戴邪恶环后，大家向它求救，小空和小京被救出后被迫和左轮兽玩牌，五角星兽回来后决定与左轮兽决斗。穿山兽吃了它的便当回复体力装甲进化后冲出了牢房。最后烈焰兽打败了五角星兽，发现并打倒了黑暗塔。后来五角星兽和左轮兽不让他们走而要一起玩牌。