小光在上课时突然感到置身于大海。阿武发现小光正在消失，大喊她，老师就叫小光去保健室。阿武下课后发现小光不在保健室，就去找她，找到后因为她太依赖哥哥很生气而斥责。迪路兽发现小光在过马路时突然消失，大辅以为她在数码世界，阿武则去海边找她。小光在一个奇怪世界的山洞里发现了被邪恶螺旋环控制的奇蛙兽，突然被飞龙兽袭击。阿武终于来到那个世界，打倒了一座黑暗之塔，发出的光使迪路兽超进化成天女兽，打败飞龙兽并解放了奇蛙兽，然而它们不是真的奇蛙兽，它们想让小光帮它们生养后代。天女兽出手攻击，使它们知难而退。

光子郎正在电脑室思索小光的事，突然发现美国的数码大门打开了，于是立即通知美美。大辅他们来到蛋蛋兽餐厅吃饭，却没有美金支付。老板蛋蛋兽要他们用劳力代替。阿武想起它就是三年前逼哥哥与阿丈工作的蛋蛋兽。这时美美和一个叫米高的美国被选中的孩子来到付帐。蛋蛋兽说自己已经改邪归正，除小京外所有人都相信它。突然金刚兽来攻击他们，蛋蛋兽奋力挡住攻击，弹出很远。米高的搭档比特兽进化成海龙兽和仙人掌兽弄掉金刚兽身上的邪恶螺旋环。突然蛋蛋兽掉下来，并攻击大家。美美坚信它是被控制的，使小京终于忍不住说出自己原来就怀疑蛋蛋兽。此时纯真装甲突然出现，麻鹰兽装甲进化成忍者兽，终于发现并打碎了蛋蛋兽身上的邪恶螺旋环。

大家从电脑上发现暴龙改造者的地域越来越大，于是立即进入数码世界。在怪蛙皇的城堡区域，大家被受到控制的花拉兽和蘑菇兽攻击，忍者兽更是遇到强敌伊贺兽。后来伊贺兽往怪蛙皇身上套邪恶螺旋环，并向忍者兽下挑战书。大家利用怪蛙皇的攻击打碎黑暗之塔，然后将其打睡过去。忍者兽战胜清醒了的忍者豆豆兽，回来商量对策。大辅提议将套有邪恶螺旋环的鞭子砍掉，遭到谴责。最后大家一起攻击，终于将邪恶环打碎。但是，暴龙改造者却毫不关心……

大家由于发现装甲而进入海底却被受到控制的超海龙兽而被困在海底。由于空气有限，大家让伊织坐紧急脱出小艇去叫阿丈来救他们。伊织碰到爷爷，因为不想说出出去的原因，爷爷就教育他不要说谎。阿丈在考试，伊织被迫说谎让阿丈出来，自己的良心受到谴责。到了数码世界，大家让伊织拿起刚找到的装甲，伊织不肯。在阿丈的鼓励下，伊织最终拿起装甲，让穿山兽装甲进化成潜鲨兽，与海狮兽一起打碎了超海龙兽的邪恶螺旋环。伊织终于懂得了善意的谎言是对的这个道理。事情结束后，潜鲨兽带伊织参观了海底。

今天是八月一日，是阿武等人第一次去数码世界的日子，新旧被选中的孩子们聚在一起纪念这个难忘的日子。在电视台，在剪辑录象带时经常发现黑影，而且每次都不同。阿武到阿和家吃饭，听到他爸爸说起这件事。第二天，电视台工作人员依然发现同样的情况，并且不断有人叫迪路兽的名字，同时光子郎发现只要有D3暴龙机，任何一台上网的电脑都可以打开数码世界大门。八月三日，大家来到电视台前，迪路兽突然感觉到一些东西，于是大家进入电视台。黑影终于现身，他就是三年前的今天为保护迪路兽和小光而牺牲的巫师兽的灵魂。他留下了“发出善良的黄金光辉”的信息以后，就离开了……

光子郎和伊织发现暴龙改造者的基地，大家决定让太一等人帮助，并利用一起去郊游的假象掩护下一举打倒暴龙改造者。小京因为非常紧张，到了数码世界以后神经非常兴奋，暴龙改造者的基地从原来的位置消失了。小京下去侦察时不小心被蜘蛛兽袭击，麻鹰兽为救她而受伤。小京非常后悔，于是小光留下来陪她照顾麻鹰兽，其他人去找暴龙改造者基地。晚上，当麻鹰兽的伤好了以后，小光和小京发现了正在天上的暴龙改造者的移动基地。