明末，郑成功兵败后，徐将军师陈近南复国心切，欲一挫满清锐气，率数心腹伏刺满州第一勇士鳌拜，终事败逃走。其后始知原来近南之结拜兄弟早被鳌拜收买；从中阻挠，近南一怒之下将他杀死，替其亡将报仇。另一方面，近南之将手下更中原清廷势力稳固，劝近南暂退台湾，容后再共谋反清策略，但近南坚决留守中原，与一赤胆忠肝之士成立以[反清复明]为本的天地会，其属下李力世，懈际中等亦誓死跟随。 光阴茬苒，士数年后在杨州市丽春院中，妓女韦春花向舆儿子韦小宝相依为命，受尽市井之徒欺凌，春花恐其子终日游手好闲，欲向知府程捕头谋一官半职。 知县吴之荣向知府告发[明书辑略]一书有造反之嫌，程捕头知此事非同小可，助荘老爷及早毁灭所有真本，反告吴之荣造谣生事，被官府揭露，遂招杀身之祸，临终向一越狱江洋大盗茅士八表露真正身份，原来其为天地会尹香主，并嘱茅十八代传口讯向鳌拜报仇。 其实韦小宝早己在知府中俞听一切，顿对茅十八之英勇所为非常钦佩，二人即成好友，决意结伴往京刺杀鳌拜。

吴之荣因未能得到半分功名，深心不忿，夜半在京城街头张贴告示，诬告浙江巡府贪赃枉法，纵容百姓著书谋反。衩鳌拜发觉，令吴之荣乇底将一千人等押京发落，使之荣受宠若惊。 茅十八闻讯后，欲纵速向天地会通风报讯，韦小宝不肯跟随，二人争论之时，惊动了老太监海老公公。海老公公知事有蹊跷，立将二人制服掳走。 茅、宝醒后，发现竟身处禁宫中，二人顿感束手无策，海老公公逼二人说出陈近南行踪，茅十八誓死不从，幸而韦小宝人急智生，乘海老公公旧病复发之时，假扮小太监小桂子将大量药粉注入酒中，海老公公服后顿即失明，韦小宝更乘机杀小桂子灭口。息料事后竟被海老公公识穿一切，副韦小宝继续在宫中假扮小填表子，着他以化尸粉将小桂花子毁尸灭迹，而茅十八更迫于匿藏于宫中。 韦小宝替茅十八找食物时，无意间遇上康熙，竟误当为太监小玄子，二人话甚投机，意心未泯之余，竟大事比武一番。

忠臣索尼等上进启奏，力指鳌拜假公济私，藉[明书辑略]一案抄斩其叛徒，以达成专横霸政的目的。怎料鳌拜突然怒闯禁宫向康熙解释一切，态度表现得甚为气焰，顿感使康熙面目无光。索尼目睹一切，力劝康熙逼鳌拜交出政权，及早亲政，康熙一时进退两难。 海老公公知韦小宝自小嗜赌成性，命他以旁门左道骗取温氏兄弟金钱，直至债台高筑时，可逼他们开放御书房，然后乘机偷取[四十二章经]。另一方面，韦小宝向海老公公陈述与小玄子比武一事时，海老公公感到小玄子实非等闲之辈，遂将一套[大擒拿]功夫传给韦小宝，用以试探小玄子真正身份。 茅十八自知不便久留宫中，欲假扮太监逃离禁宫。息料途中遇上天地会中人抢救荘家从人，大事未成，竟误当茅十八为清廷要 ，乘机将他劫走。 康熙认为鳌拜所为过于专横，有损民心，决令他交出兵权。怎料鳌拜自恃势力庞大，对康熙命令视若无睹，更加大朝中大臣对他奉承，康熙更感孤掌难鸣。

韦小宝颠倒是非温氏史弟做打扫工作，乘机潜入御书房追寻[四十二章经]下落，怎料刚巧遇上康熙与鳌拜争论国事，始知一向与自己比武的小玄子，原为当今皇帝康熙，不禁悲喜交集。而康熙知真相已露，要求韦小宝以后排除尊卑关系，私下仍为好友。 鳌拜为铲除政敌后患，竟假传聖旨将忠臣苏克隆哈全家抄斩，康熙阻止不及，深感鳌拜太过专权，遂决意择吉亲政。 怎料康熙亲政首天，朝中大臣均避于上朝，而鳌拜更诈病拒参与亲政大典，康熙一时行动，怒闯鳌府调查真相，又将满腔怒愤浇在韦小宝身上。后韦小宝灵机一触，急召一班少年勇士，加紧进行摔角训练，表面上为健力强身，实暗地为对付鳌拜铺路，另一方面，鳌拜发觉康熙态度渐变，以为康熙之所以要亲政，实一时意气用事之举，对他防备渐疏。 原来海老公公早已知道康熙身份，向韦小宝表明态度，以死威协韦小宝交出[四十二章经]，合小宝顿感不知所措。

康熙见众少年摔角手训练纯熟后，藉词召鳌拜指点各人武功，在危急之际，康熙示意众少年向他围殴，韦小宝乘乱将他制服。康熙惊魂稍定后，急召朝中大臣，宣称鳌拜行刺聖上经过，下旨将他收监，永不释放，并顺带将其余 制服，众臣眼见局面全非，极力向康熙讨好，以便从中得到大权。 康熙以韦小宝护驾除奸有功，立将他提升为首领太监，奉侍皇上起居， 着他与两索额图往鳌府办理抄家手续，并嘱他为太后寻出两部[四十二章经]。索额图眼见韦小宝顿成皇上身边红人，连向他巴结一顿，定要与他结拜，还以五十万银两、一宝衣及宝剑相赠，使小宝万分惊喜。 太后喜获经书后，对韦小宝先锋赞赏不绝，命宫女蕊初赏些美点。韦小宝实与蕊初一见如故，并私约外出游玩。 康熙恐鳌拜当众拆穿一，有损声誉，命韦小宝出面除鳌拜。韦小宝以蒙汉药毒鳌拜后，适逢天地会中人闯行刺鳌拜，韦小宝实与鳌拜苦时，鳌拜几番挣扎后，终被小宝以宝剑刺死。天地会中以为韦小宝英勇过人，对他佩不己。

天地会中人行刺鳌拜时，惊动了康亲王府侍卫，喝令他们从速投降。天地会各人乘机协持韦小宝为人质，将他运出康亲王府，康亲王为顾全韦小宝安危，未敢轻举妄动。 韦小宝被运入天地会会堂后，众人产靖木堂尹香主沉冤得雪而大事庆祝一番。韦小宝当众表白自己身份，并得茅十八及时出现，替他解释一切，众人疑心全清。茅、韦二人久别重逢，诉尽别离之情。其后更为香主及承继人一事，彼此争论不休。 此时天地会总舵主陈近南赶至，韦小宝对他道出自己身世，近南亦颇欣赏其坦率态度。而原来当日青木堂中人会立下一誓约，若谁能杀鳌拜者，众一愿推他为香主，近南遂应誓，韦小宝实惊喜之余，终答允行事，近南更想藉韦小宝之特殊身份，以便作反清复明之内应，众人皆为之心服。近南更破例收韦小宝为徒弟，着他要勤加练武。 海老公公与韦小宝反面以毒药迫他交出经书，小宝欲以假经书哄骗海老公公，终被他识穿，一怒之下将小宝打至重伤昏迷，海老公公以为他死去而原来韦小宝有宝衣护身，大难不死。