小宝充当少林高僧后，终日无所事事，与双儿嬉戏，被阿珂、阿琪撞上，以为小宝存心调戏良家妇女，三人几番争执后，小宝竟出手侮辱阿珂，被晦聪责备，将他送入寺内疗伤，而小宝则被除数阿珂之美态所深深吸引，多次欲向期解释，但又恐二人会因此乘机向他报仇，遂向澄清谋求对付招数。 珂、琪对小宝含恨在心，一直伺机向他报复，后跟踪小宝至一妓院中大吵大闹，小宝竟混入妓院中逃生。阿珂受屈未伸，竟意图自尽以表清白，后被噶而丹三子及时阻止，替其向少林众僧调查真相，后得杨溢证实小宝为宫中太监，阿珂含羞而逃。 曾柔无意发现吴应熊意图谋反自立的阴谋，顿觉被利用，一时怒火中烧，大事向应熊理论，赵齐贤及时调停，将她交给小宝，小宝也乐得有美当前。怎料好景不长，小宝接到康熙密旨，令他赴五台山，充当清凉寺主寺，二人迫于分手。

吴三桂勾结蒙古及西藏众喇嘛围攻五台山，意图劫走顺治作为人质，以威协康熙交出帝位。小宝获悉后千辛万苦游说玉森、顺治及早离去顺治自己罪孽深重，为平天下纷争，欲与玉林自焚了断。 小宝恐有失康熙所望，在众喇嘛僧重重围困下，以偷龙转凤之法将顺治、玉林等偷运下山，顺治感到小宝能不伤情命却能脱险，对他称赞不已。 原来康熙早已闻得吴三桂图谋造反，遂不异长途跋涉远赴五台山，小宝尽法制造机会使他与顺治会面。顺、康二人久别重逢，不禁相拥而泣，顺治千叮万嘱康熙要以国民生活为重，并将满清宝藏密说出，劝康熙他朝一日民变成功，可及时退出关外。 康熙含泪离去后，突被激发万丈雄心，立志为中于国家干一番大功绩，并着小宝与他回京，尽力协助政事。

九难为报家仇国恨，毅然向康熙行刺，不敌，意将小宝协持作为人质带走，康熙等人以为小宝会因此凶多吉少。 原来当年李自成攻破京城后账平公主为避受满州长凌后辱，从此剃度为尼，法名九难，一直为存报仇之念而勤加练武，默然等候机会向康熙行刺。直至此次行刺不遂后，九难感怀过去带同小宝偷潜入宫，小宝对她的身份起疑心，乘机向她引见陶宫娥，始知原来陶宫娥是长平当年的近身宫婢，主仆二人抱头痛哭声尽诉别离之情。 康熙回京后，发觉经书顿失后大事质问，太后终不肯交出，但康熙因早受顺治所嘱，未敢对她赶尽杀绝。 九难报仇心切，欲与陶宫娥暗取八部[四十二章经]，一方面可大破满清龙脉，其次可实行复明的度划。而小宝念于与康熙之友情，苦苦哀求九难莫伤害康熙，并极力协助九难对付太后。

小宝、九难夜闯兹宁宫时，发现原来太后乃一直为明朝一败将之女毛东珠所假扮，多年来将真太后办禁于宫内一密室内，爱她说出经书秘密，九难惊诧之余，立将东珠武功全废，命陶宫娥密切监视其行。 小宝在一偶然机会下，发觉阿珂竟为九难之徒弟，小宝更感意乱情迷，尽力设法亲近阿珂，对九难阿谀奉承。九难亦颇欣赏小宝之才干，决意利用他协助反清行动，而阿珂对小宝仍怀恨在心，处处对他为难，但九难事事袒护小宝，使阿珂心感不服。 小宝为向阿珂表现其英雄气慨，假意被数名流氓 自己，怎料途中被郑王府郑克块相救，阿珂被其翩翩风度所吸引，顿对他芒心暗许，二人话甚投契，小宝见之醋意大生。 各家门派刘集岳王庙召开[杀 大会]合力商讨计策诛灭吴三桂。众人推举近南为总军师父冯锡范为盟主，小宝乘机指使天地会中人恶言中伤克块，使他尴尬万分。

西藏喇嘛桑结力逼九难交出经书，九难乘乱将地图碎片交于小宝，后终得小宝施计以蒙汉药及化尸粉吓退众喇嘛，九难极为欣赏小宝临危不乱的胆色，遂允收为门下。克块、阿珂则感到小宝为作所为乃市井无赖之行经，对他更起反感。 小宝眼见珂、块二人朝夕相对，感情进展神速，遂设法向沐王府从中挑唆。吴立身果然中计，将克块痛打一顿并在阿珂面前，故意中伤克块在外拈花惹草，使阿珂大为震怒。后吴立身更大将计就计，强迫小宝与阿珂拜堂成亲。 平西王府杨溢之奉命调查各派反吴三桂一事，小宝乘机 他掳走克块，幸而冯锡范及时相救，克块得以脱身。 小宝奉九难之命回宫追寻其余经书下落，康熙向他追随者问被行刺一事，小宝将一切罪行推卸在三桂与克块身上，康熙勃然大怒，深思对付二人策略。

小宝向康熙道出真假太后一事，二人立闯慈宁宫调查真相，高头陀知形势不利，乘乱将东珠抱走，康熙后与真太后重聚天伦，喜极而泣。康熙为嘉奖小宝之英勇行为，特升他为一等子爵。 康熙迫康亲王交出经书，小宝假装对良亲王极为开心以一假经书交给康亲王，信以为真，令他大各感动。 克块一直恐近南势力扩张，会影响其延平王府地位，遂暗向近南行刺，以一挫天地会锐气。小宝乘乱以石灰粉制服二人，反被近南斥为对国姓爷不敬，众人均暗感不服。 小宝为达成天地会各人所愿，另一方面又可向康熙立功，特派多隆生擒克块师徒治罪。康熙计从心生，决亲自假扮近南数人求出二人，欲乘机向天地会挑唆是非，间拉引起二派纷争。