正当小宝、双儿查出宝图汉译地名，意欲远赴鹿鼎出寻宝之际，康熙突封小宝为钦差大臣，表面上嘱他上长白山祭天为名，实乘虚攻入神龙教中人，一时不知所措。 克爽带阿珂引见郑皇爷妻董夫人，怎料董夫人早对阿珂身世背景极为嫌弃，对她态度甚为冷淡。而克爽更在锡范影响下。要以王府声誉为重，另立正室。阿珂闻讯大受刺激，终含泪而去。 原来董夫人一直对克爽异常偏爱，极力推举他为延平郡王，不异将郡皇爷及大公子克坚软禁，近南闻讯忿忿不平。而董夫人恐近南会从中阻挠，遂暗中挑拨锡范，对近南痛打一番。 特派风际中等远赴台湾救出近南。而近南感延平王府内形势，心感痛伤，誓死早日反清成功，全力协助克减重振声威。 小宝在郑成功远将施良策划下失分三路海攻神龙教。

小宝被押向教主解释一切，小宝乘机将一切罪状嫁祸于高头陀身上，并反告矮头陀半信半疑，着小宝从速交出经书。 小宝见形势不利，遂不异冒险，与双儿逃离神龙岛，几经辛苦始逃至鹿鼎山。 怎料途中遇害上洪教主与夏相国二人，正在密谋商计拉拢罗杀国彼得王子联盟反清计划，更协助彼得暗杀其姐苏菲亚公主以夺取兵权。小宝识穿一切后，暗助苏菲亚脱险，并将一切经过真相向她陈述，使她恍然大悟。 苏菲亚为确实彼得阴谋，特召洪教主，夏相国到会，敲侧声试探二人，小宝更乘机取出彼得手谕为证特，二人无词以对，苏菲亚遂即回国向彼得算帐。

吴三桂联同耿精忠、尚可高向康熙表示撤满清用以试探康熙反应，康熙一时不知应对。小宝突向他声称已拉扰罗杀国为邦交国，而更可藉此联手对抗叛国军，康熙如获至宝，遂能三番所求。 应熊为免引起康熙疑心，假意请求小宝劝康熙收回撤藩成命，但小宝则置于脑后。另一方面，应熊恐三桂造反后会沦为俘虏，遂假意相约小宝与他野外赛马，欲藉此机会逃回云南，怎知小宝暗中施计弄伤应熊坐骑，应熊逃走不遂之余，更被康熙押返京城收监。 教主率陆高轩到客栈寻回经书，不果，刚巧遇害上剑屏，苏荃乘机将她擒住，迫小宝交回经书。 小宝奉康熙之命与吴六奇余平王屋派 原来当时司徒伯雷已被三桂手下灭口，小宝趁机劝王屋派壮兵加入天地会，而会柔更乔装侍卫终日与小宝为伴，伺机向三桂报仇。

阿珂自从离工延平王府后，生活潦倒，后巧遇克块，克块以甜言密语骗得阿珂与他和好如初，并欲联手向小宝算帐。 小宝抵杨州后，心情极为兴奋，以年前装束重返丽春院与韦春花重聚。怎料洪教主偕同苏荃、方怡先进单位收扮妓院侍俾，欲向小宝报仇，幸小宝人急智生，以蒙汗药毒害众人。 机缘巧合下，苏荃、方怡、沐剑屏、双儿、阿珂、曾柔等六人分别被点穴或迷晕，小宝一不做二不休六女以大床全部带回饮差府，尽享温柔福。事后众女竟因误会大打出手，局面混乱不堪。 小宝见双儿为庄家仇未报而郁郁寡欢，遂造谣反告吴之荣为三桂同党，亲押吴之荣往庄家发落。途中双儿与吴六奇甚投契，决结义金兰，六奇以一炎送于双儿。

由始至终辛树一家三口夜闯平西王府，向三桂索取[千年野山人参]，三人感恩图报，决义助三桂刺杀小宝。 怎料三人刺杀途中被吴六奇阻止，归忠忙乱中将六奇杀死，双儿非痛欲绝。后得近南向辛树等陈述是非由来，原来辛树对近南为人甚为钦佩，听后内疚不已，欲以死谢罪，近南及时阻止，劝其应回家共商反清事宜。 近南与沐王府、王屋派等策谋起兵详情，归辛树三人不理各派劝阻，欲先行了断康熙测，遂派人暗中通知康熙，稍后更将一切罪嫁祸在三桂身上。 正当三桂起兵造反，以致数地失守之际，建宁发觉自己已怀小宝骨肉，遂要求康熙早将应熊处死以断祸根，而康熙更觉此举可一挫三桂锐气，遂下令依计行事。 归氏入宫行动时，小宝迫令东珠假扮康熙匿于轿里，指使辛树向轿中人行刺。

康熙发觉小宝为天地会份子后，向他大事质问，小宝大惊失色，极力替自己掩饰，康熙不为所动。后更向小宝表示会逐一消减天地会、沐王府等反清组织，同时更派多隆将小宝软禁，以防他向天地会通风报信。 归氏三人连夜暗闯禁宫行刺康熙，众侍卫方寸大乱，幸小宝及时冒死保护。康熙大为感动，力劝小宝协助产除反清组织。 小宝不忍天地会兄弟遭受损伤，遂连夜将多隆制服，以建宁公主为人质，施计救出近南等人。康熙闻讯勃然大怒，下令全国通辑小宝等人。 正当小宝逃往[通吃岛]途中，洪教主乘机阻挠，逼他交出经书。幸陆高轩等乘乱反抗救主，但几番苦斗后陆高轩等人俱被打死，时教主发现苏荃已怀小宝骨肉，教主大受刺激下盛怒而死。