宇宙纪元７０年。为追求经济圈的确立，札夫特军(调整者)与地球联合(自然人)的摩擦以「血腥情人节」的悲剧为契机，发展成武力冲突。拥有MS的扎夫特军在各地都获得压倒性的胜利。浮在L5的中立国「欧普」的资源卫星「海利欧波里斯」。煌.大和是在该地的工业大专院校上学的学生。像往常一样去听讲的他，在那里遇上了扎夫特军钢弹夺取作战行动的现场。海利欧波里斯因为工厂各地发生的爆炸及侵入殖民地的MS基恩而陷入混乱。奇袭行动成功致使联合军秘密制造的五架最初的MS”钢弹”，有三架落入扎夫特的手中。煌在临近的工厂中寻找避难场所，偶然目击剩下的两架钢弹。在那里他遇到了潜入的扎夫特军人，过去的好友阿斯兰．萨拉。两人困惑不知如何是好。另一方面，工厂内的爆炸越来越大。地球军的事官玛琉．拉米亚斯的强拉煌一起进入攻击钢弹的驾驶舱。在红莲火炎中，钢弹现在即将站起。

在熊熊燃烧的火舌中，煌与玛琉进入攻击钢弹驾驶舱。虽然勉强逃离了爆炸的工厂，马上又面临等待的扎夫特的ＭＳ基恩！受伤且本就不是驾驶员的玛琉，自然无法驾驶钢弹。陷入遭受基恩攻击的大危机时，煌挺身而出代为操纵。他以令人惊异的速度修正了钢弹的ＯＳ。发挥攻击钢弹的潜能，以压倒性的力量击败基恩。逃过一劫的煌与友人被玛琉以知道军方机密为由，遭到拘捕。虽然不平，但也只能服从。同一时间，穆察觉拉乌的行动，也赶往海利欧波里斯。在战场相会的两架一边交战一边闯进殖民地里面。另一方面，被关在遭爆破的矿山内的娜达尔，组织剩下的几人一起启动大天使号。此时海利欧波里斯开始有令人害怕的鸣动。其中，拉乌控制的ＭＳ席古与攻击钢弹展开了战斗。煌被身经百战的拉乌玩弄在手掌心。即使有穆加入支持，形势依然不办。就在千钧一发的一刻，大天使号突破岩壁，现出其威容。

拉乌的席古攻击煌等人。此时大天使号在众人面前现身了。乱斗中，攻击钢弹瞄准拉乌射击，竟然将殖民地误击出一个大洞。众人都被那个威力吓得目瞪口呆。拉乌见势不妙，立刻脱离。煌等人上了大天使号。见到开动钢弹的人竟然是个小孩，这事实震惊了在场士兵。穆看出了煌调整者的身份。 另一方面，返舰的拉乌感到钢弹的性能是个崴胁，决定再度攻击。阿斯兰在未许可的情况下，擅自出击，驾驶神盾钢弹去找煌。被煌改写ＯＳ的钢弹除了煌，任何人都无法操纵。虽然煌拒绝操纵，但是面对敌人的逼近，煌并没有任何选择的余地。再度展开的战斗，又重伤了殖民地。煌击落了米盖尔的基恩。与驾驶神盾钢弹的阿斯兰在战场上又再度交手。两位少年为彼此的敌对立场而困惑。另一方面，身边的战斗也更加火热化。受到致命性伤害的海利欧波里斯，开始崩溃。

煌从崩溃的海利欧波里斯的宙域带着逃生艇一起返回大天使号。芙蕾也在那艘船上。大天使号采取前往友军军事卫星阿尔缇蜜斯的航路。拉乌在一度跟丢大天使号之后，又推算出大天使号的行动，采取了切断进路与退路的作战计划。归舰后，煌与托尔一起待在难民居住区。对于提出的维护钢弹的要求，煌反弹地表示自己并不是驾驶员。另一方面，被拉乌质问上次擅自出动原因的阿斯兰，表明了自己想劝服友人煌的意向，表发誓万不得已时，会亲自杀死好友。事态如拉乌所预料的，大天使号遭到前后夹击。战斗配置的警报声响起，托尔等人顾及煌的负担，自愿加入帮忙舰桥的工作。独自烦恼的煌被穆的话与朋友的行动打动，决定再次驾驶钢弹。引擎起动的同时，大天使号的特装炮发射了。彷佛以此为信号，敌舰也放出了ＭＳ队。煌在弹射器的位置上大喊“煌大和！钢弹出动！”

攻击钢弹面临被夺走的四架钢弹。煌与阿斯兰在战场上再度遭遇。决斗钢弹插入两人之间，暴风钢弹、电击钢弹也过来会合，战况极度混乱。另一方面，先行出击的穆突袭符泽琉斯号，严重受损的符泽琉斯号因而被迫脱离。向阿尔缇蜜斯的伞进攻的伊萨克、迪安卡无视撤退命令继续攻击煌。由于不适应战斗，消耗了大量能源的攻击钢弹的相转移装甲都自动失效，陷入大危机。此时，MA形态的神盾钢弹带走了煌。 互相冲突的想法，以及决别。在穆的支持下，煌换上重炮型攻击装备，勉强击退伊萨克等人。

勉强摆脱札夫特追击，大天使号逃进了阿尔缇蜜斯军事要塞。但是在那里等着的，是友军士兵对向自己的枪口。 大天使号的船员们遭到要塞司令官加路西亚软禁。虽然同属地球联合军，玛琉等人属于大西洋联邦，可是阿尔缇蜜斯是属于欧亚联邦的要塞。并非完全相同。加路西亚企图以大天使号和钢弹为礼物，藉此荣升回地球。加路西亚以友人为盾牌，要求煌解除钢弹被上的锁。同一时候，在远方的伽莫夫号正对阿尔缇蜜斯展开讨论。阿尔蜜斯一向以全方位光波防御带这个特殊的防御武器来击退攻击的敌人。然而，电击钢弹的幻象化粒子，却突破了这个防御武器。受到突然攻击的阿尔提蜜斯，里面的士兵因对光波防御带有绝大自信而纪律松弛，根本无法应付意料外的事态。煌趁机逃脱进入打击钢弹，迎击攻来的电击钢弹。然而外面还有决斗钢弹与暴风钢弹在攻击阿尔缇蜜斯。与电击钢弹的战斗导致要塞破损进水，煌与逃脱的大天使号一起离开了这个开始崩溃的无敌要塞。