喜莲把胡半仙带到后花园找明心，看到吴成与明心在花园恩恩爱爱的样子，喜莲非常羡慕，希望明心永远这样幸福下去，并说如果有人破坏明心的幸福，自己一定不得轻饶他。喜莲的话让胡半仙到嘴边的话又咽了下去。但他还是不服，于是找到让华佗来做这个恶人。

华佗得知九转丹的事果然非常气愤，他劝吴成不要一错再错，要有医生对待病人的责任心，而不是一味地想着自己的功名利禄。吴成没有反思自己的过错，反而以小人之心度君子之腹地认为华佗在遴选太医的非常时期提九转丹的事，就是想让他不能顺利参选太医，一定是华佗起心想参选，借此除掉他这个强有力的竞争对手。华佗觉得吴成执迷不悟，反而担心他这种心术不正的人如果真进了太医院将来会害多少人。于是华佗决定参加遴选，让吴成这种人没机会害人。

参加遴选的大夫们汇集在集市上支起了问诊摊，以此展示各自的医术。华佗和吴成的诊台前都拍起了长队，胡半仙的诊台无人问津。这时牛二因为扭伤了腰被家丁们扶着过来了。他把华佗诊台前正在看病的李三驱赶过去，然后得意地扔出一袋钱给华佗，让他给自己先看病。华佗收下他的钱袋，一股脑全倒在地上，牛二赶紧蹲下去一枚一枚地拾起来。华佗又对李三耳语一番，李三于是在华佗暗示的牛二的背上踢了一脚。牛二勃然大怒，正要发火，华佗却告诉他，他的腰伤好了。牛二扭扭腰感觉腰果然好了。华佗告诉他让他拾地上的钱是帮他先活动身体，让李三踢他是帮他正骨。华佗不同寻常的治病方式引得围观百姓纷纷称赞，也引起了围观人群中太医官甄太医的注意。

次日，甄太医在县令陪同下再次到问诊处查看。看到华佗正用针灸的方式为要做小手术的病人麻醉，果然病人感到的是还能忍受的疼痛，华佗顺利为病人做了小手术。华佗的这个麻醉术引起甄太医极大的兴趣，却也让吴成和胡半仙感到更大的威胁。于是吴成给胡半仙出了一计，让他算计华佗让他当中出丑。

翌日，胡半仙给一个健康的小伙子一枚银锭作为演出费，让他故意装出摔倒的样子让华佗医治，然后戳穿华佗的医术。果然，华佗开后，小伙子突然摔倒，装出痛苦的样子，华佗赶紧为他号脉检查，发现小伙子怀里的银锭咯伤了他的脾脏，结果华佗深感遗憾地说小伙子危在旦夕，因为他的脾脏受了重伤。小伙子得意地告诉华佗自己没病，只是被人请来演戏的。华佗让众人把他抬到医馆由华父诊断，果然小伙子开始吐血，如华佗所说命不久矣。胡半仙吓坏了，找吴成出主意。吴成却突然换做自己一无所有与自己无关的样子，然后递给他一串铜钱让他离开逃走。胡半仙见吴成推得干干净净顿时傻眼了。

太医院遴选工作第一轮实践比试已经结束，甄太医公布的名单中华佗位列第一，吴成第二。吴成装着不经意的样子故意透漏给明心，还装出一副不在乎仕途只为不能娶到明心的无奈。于是明心找到华佗，希望他退出遴选成全吴成。华佗告诉她自己不为名利，只因吴成心术不正。明心恼怒，觉得华佗还在打击报复。华佗不得已将吴成给明心用九转丹导致其眼疾告诉了她。明心不相信，她希望华佗不要诬陷吴成，成全她和吴成的婚姻。华佗见说服不了明心，只得答应了她。吴成如愿考入太医院。临走时将为明心治病的事交给了华佗。吴成走后不久，明心眼疾再次发作。华佗没有能力医治，于是带着明心准备去京城太医院。

途中，他们偶然救了被官兵追赶的一对母子，得知前方镇子里的守卫将军夫人身染重疾，镇上来的天师说是夫人染了邪祟，要用童男童女祭祀。华佗赶紧赶过去，想救下这些孩子。明心见华佗穿着木屐脚都磨烂了，于是把她为吴成做的新鞋子给了华佗一双，让他穿上新鞋去见将军。华佗穿着这喜鹊登梅图案的新鞋心里美滋滋的。哪知刚出门就被士兵抓了起来。原来天师抓了童男童女后，说再抓一个穿喜鹊登梅鞋的人就够了。华佗正好就撞上了。

将军把华佗和童男童女们抓到广场，要拿他们祭祀。将军夫人闻讯拖着病体赶了过来，让将军放了抓到的这些人。将军夫妻情深，担心夫人果真中了邪祟离开自己。华佗提出要见一见天师。结果一见之下，竟然是胡半仙。一切真相大白，知道所谓的邪祟皆是胡半仙在坑蒙拐骗。华佗亲自为夫人看病，仔细检查过后，华佗查出夫人腹中有死胎，所以才一直腹痛难忍。将军大怒，说自己在外征战两年未归，夫人何来怀孕一说。华佗让将军稍安勿躁，待他医治后看结果再说。

华佗为夫人针灸，不久后夫人果然产下死胎。将军勃然大怒，以为夫人背着自己与他人有染。华佗解释说夫人一年前曾经流产，当时是双胞胎，但只流下一个，另一个死胎一直在夫人腹中，所以她才会一直腹痛难忍。将军夫妇澄清了误会，又治愈了顽疾，对华佗感激不尽。

华佗一行人终于到了京城，京城果然热闹非凡。明心和天来兴奋地在集市上东瞅西望目不暇接。天来看到小摊上售卖的弹弓很是喜欢，但华佗却觉得弹弓不安全容易伤人。天来恋恋不舍，明心诚心要与华佗作对，坚持把摊位上所有的弹弓买下来送给了天来。天来很高兴，华佗却气急败坏，责怪明心不该惯着天来。结果转眼之间天来用弹弓射中路旁拴着的马匹，马吃痛受惊狂躁地挣脱缰绳，撞倒了天来后还要狂奔。华佗想办法制服马匹后赶紧查看天来的伤情。

有两个人恶狠狠地过来责怪他们惊扰马匹，华佗非常愤怒他们把马匹看的比人还要重要。这时一个红脸大汉上前向华佗道歉，华佗以为他是那两个恶人的主人，对他也没有好感，气呼呼地离开了。哪知次日红脸大汉找到华佗的住处，真心诚意地送来诊金还要送天来去太医院诊治。一来二去后两人相谈甚欢，意趣相投，华佗得知他竟然是桃园三结义的关羽顿生敬意。关羽也对华佗的一些看法和为人甚是欣赏，两人顿感相见恨晚结为好友。

吴成把明心带到集市上想给她买最出名的包子铺的包子。结果被一个胖妹强行抢下铺子里所有的包子。胖妹趾高气扬仗势欺人，吴成不想惹事准备隐忍，喜莲却脾气火爆不依不饶。胖妹本想发火，可一看到一表人才的吴成顿时装出一副温柔腼腆的样子。从集市回来后，胖妹便对吴成念念不忘。原来胖妹是太医院甄太医的妹妹甄依柳，因为父母双亡，甄太医对这个妹妹娇纵宠溺，以致她刁蛮任性飞扬跋扈。

吴成次日离家准备去太医院时，甄依柳竟然守在门外给他送来了包子。吴成看到她硕大的比自己身体都宽两个的身躯，赶紧避而远之。甄依柳却看中了他。等吴成傍晚从太医院回来时，甄依柳竟然又守在他家门外，极力表达对他的好感。吴成想到白天太医院讨论到的甄太医的妹妹，说是她一边暴食一边让他们研究减肥药方。联想到眼前这位，吴成便向她打听姓名。甄依柳转念一想，故意说自己姓陈。

吴成好不容易摆脱了甄依柳的纠缠进了家门，华佗问他什么时候到太医院为明心看眼疾，吴成又推三阻四找借口。华佗却心急的要自己带明心去太医院。明心看到吴成的态度很不开心。

明心的眼疾越来越严重，这一天她又再次短暂失明。华佗已忍无可忍，迫不及待地亲自带明心到了太医院。他正在打听吴成时，突然看到门口刘太医将吴成开的药方扔在地上，然后把他贬低的一文不值。华佗眼见吴成受这样的窝囊气义愤填膺，气冲冲地与刘太医理论。刘太医根本看不起他。

这时江大人行色匆匆地走进太医院找贾太医，窃窃私语地请贾太医看病。贾太医为难地告诉他自己专攻的是眼科，对他的病不会治。华佗冲进来不动声色地为江大人号脉，说自己有办法帮他治肾虚。华佗一下子说准了他的病症，江大人愣住了。华佗不由分说地取出针为他针灸，等江大人反应过来，华佗已为他针灸完毕。江大人顿感神清气爽，华佗让他回家试试看是否有效。华佗立竿见影的治疗肾虚让太医院等人有些刮目相看。但贾太医却怕得罪刘太医等人。所以推说自己不是唯一的看眼疾的太医，让华佗找其他人。

正争执间，甄依柳来到太医院找吴成。吴成不胜其烦，告诉她自己有心上人，不喜欢她这种硕大体型的人。甄依柳还要纠缠，华佗忍不住对她的体型直言不讳，甄依柳这下子不依不饶地大吵大闹，引来了太医院医丞甄太医。甄依柳看到甄太医闹得更加欢腾，吴成这才知道胖妹原来是甄太医的妹妹，这下他算是把甄太医彻底得罪了。

吴成小心翼翼地到甄太医家里求得他的原谅。甄太医却要华佗来认错，还让华佗交出麻醉药的药方，不然就不让他们再在太医院出现，更不要说帮明心看眼疾。华佗看甄太医醉翁之意不在酒，非常气愤。他决定干脆去找曹操解决。

江大人表情尴尬地被夫人拉到太医院。夫人责怪太医院的不该没治好江大人的病，还让他似乎更加严重了。为了下半生的幸福，她要求太医院治好江大人的肾虚之疾。

江大人的夫人在太医院大吵大闹，吴成提出帮江大人针灸治疗。江大人对吴成的医术持怀疑态度，众太医也让他不要逞能。吴成觉得这是自己难得的表现机会，再加上他也对针灸治肾虚比较有把握，于是他放出狠话，若治不好自己从太医院引咎辞职。众太医抱着将信将疑的态度看他为江大人医治。果然，三针下去，江大人称有感觉，似乎好了很多，然后江夫人喜滋滋地和江大人回家了。

曹操府里的侍卫突然到太医院传令，让所有太医到丞相府为曹操治疗头疾。曹操的头疾是老毛病，久治不愈，发作起来头痛欲裂。众太医慌忙赶去，吴成正准备随同一起，却被甄太医呵斥，让他留在太医院打扫卫生。吴成很失落，越发感到自己在太医院不得志。众太医为曹操拿出了很多药方，但都不能标本兼治，惹的曹操大发雷霆。

华佗在居所突然被丞相府侍卫传令，让他去给曹操治病。原来因为江大人在曹操召集众官员时缺席，曹操问及江大人时才从别的官员口中得知华佗大闹太医院的事，也才知道华佗在京。华佗到了丞相府看到两侧众太医神色凝重小心翼翼。华佗却大呼小叫放浪不羁，看到曹操更是直呼其名毫不拘谨。曹操也知道这昔日老友的脾性，不与之计较。华佗看到众太医为曹操开出的药方，一个个否认后扔在地上，引得众太医敢怒不敢言。

华佗用针灸麻醉之术为曹操治头痛，几针过后疼痛立解。曹操大喜，要亲自送华佗回居所，准备与他把酒言欢。吴成看到华佗带回来的竟然是当今丞相，十分惊诧。曹操对他却视而不见，让他为自己和华佗喝酒时添酒加菜。吴成不敢反驳，却暗自恼怒。华佗将天来介绍给曹操看，天来看到曹操认出他竟然是杀死家人的凶手。原来天来是吴伯的孙子，当初曹操误杀吴伯一家时，天来躲在草垛里逃过了一劫。但却因为受了惊吓再也说不出话。天来看到曹操十分惊恐，排斥曹操拉他的手。华佗和曹操都以为他是怕生。

曹操走后，明心隔着窗看到吴成一副失落不得志的颓丧样子。虽然华佗向他道歉，还答应将麻醉针法教会他，让他以后给曹操看病谋取一个向上发展的前途，吴成还是很生气，觉得华佗来后给他惹了不少事也出了好多风头。

晚上明心隔着门与屋内的华佗谈心。她怕自己面对华佗时说不出口。她告诉华佗虽然两人分开七年了，自己在心里不断提醒是华佗害死了她奶奶，可她就是放不下华佗，不能忘记他。她希望华佗第二天就回谯郡，她不希望华佗影响她好不容易接受的吴成。她问华佗是不是忘了她，华佗为了不让她徒增烦恼，违心地说自己已经忘了过去的事。明心听了这话彻底失望了。她难过地回到房里。

吴成心中郁闷，在酒馆拼命喝酒，他恨华佗出尽风头，他怨自己受到排挤。心胸狭窄偏执的他把这一切都怪罪于华佗身上，对华佗是恨之入骨。次日清晨等他回到家中，明心告诉他华佗已经走了，准备回谯郡。吴成想到华佗曾答应要教他麻醉之术，他也只有可能借掌握这个独一无二的技能才可能在太医院站住脚。他赶紧把华佗追了回来。

华佗因为与曹操的关系，如今在太医院可以自由出入，曹操还命太医院从人力和物资上全力配合华佗。华佗却直言不讳地说自己只想请贾太医治眼疾。刘太医听说后主动请缨，华佗不知道刘太医的医术如何，不敢冒然为明心换医生。贾太医却是个胆小怕事的人，他赶紧出来打圆场，偷偷跟华佗说等刘太医为明心诊治完了自己再偷偷来诊断一次。华佗这才松口请刘太医为明心治眼睛。

刘太医果然是从太医院出来的，他为明心检查后指出明心系中毒所致。华佗顿时对刘太医刮目相看，才相信刘太医果然有点本事。华佗虚心地将自己开的排毒的药方向刘太医请教，刘太医指出将其中的两味药换成另外两味，效果肯定不一般。刘太医专业的建议让华佗佩服的五体投地。

华佗用他找人打造的各种手术刀第一次为关羽的战马做手术。手术的成功让关羽叹为观止。曹操这时命人将从吕布那里夺回的赤兔马送给关羽，关羽对赤兔马喜爱有加，但他还是拒绝了。虽然刘备生死不明，但他还是一心只想辅佐刘备。关羽对结义兄弟的这种大义，让华佗心生敬意。

刘太医很尽职地为明心治眼疾，把他研究的治疗药方给华佗看。华佗很感激他也非常信任他。因为华佗还约了贾太医，于是华佗放心地让刘太医留在他的房间，自己出去见贾太医。没想到华佗前脚离开，刘太医就在华佗用的针灸针上做文章，他偷偷地往上面下毒。原来刘太医对汉朝死忠，梦想着有一天重振汉室，他按照大哥的命令和他的一干弟兄一起商量了下毒，所以他才千方百计接触华佗。

甄依柳依然肥胖，依然缠着吴成不放，但她实在是减不下来。她到吴成家里一哭二闹三上吊，却始终打动不了吴成的心。于是她反其道而行之，另想了一计。既然吴成喜欢明心那种瘦子，而自己减不下来，那不如把明心变成胖子。于是她假惺惺地认明心为姐姐，给她送各种食物，希望她快点吃成胖子。由于她每天过于殷勤，明心很快发现她的用心。于是她故意在酒楼里定下一桌美食宴请甄依柳。甄依柳抵抗不了诱惑，又大吃一顿。等她醒悟过来又后悔纠结的要死。