原随云无意间发现自己只是清风师太与浪子燕三郎所生的私生子，顿觉晴天霹雳，更加上发觉枯梅一直只为利用他作为报仁宪负情之仇的工具，更为愤怒。但因时机尚未成熟，只好强抑情绪，伺机迫仁宪交出帝位。

原随云为离间仁宪与楚留香的感情，讹称楚留香为蝙蝠宫内奸。枯梅师太看在眼内，顿明自原用意在孤立仁宪势力，唯劝仁宪谨慎从事。

丁枫以为楚留香武功全失，亲向楚袭击，怎料楚已被张简斋诊疗康复，丁枫卒败于楚手中。灵芝甘被原利用陷害楚等人，其实只为博取原之感情。怎料事后原对她大为冷淡，使她大失所望，向他大事质询，原不愿为此而乱大事，唯以婚事安抚灵芝。

枯梅师太眼见原为争取帝位而不择手段，特遣原上华山视察情况。原乘机引盛兰同行，欲出其不意杀死盛兰，幸枯梅与薛衣人、笑人及时赶至，苦战一轮后，枯梅不慎被原踢下悬崖，众人大表担心。

原随云作贼心虚，反诬告薛衣人害死枯梅师太，仁宪悲愤之馀，下令将薛氏父女及盛兰收监。楚顿对个中真相大起疑心，决意查个水落石出。

古大鹏派大军围攻华山，欲藉此抢回四皇爷，亚男、胡铁花等胁持四皇爷匿藏石室中，华真真更乘机逃下山求助。楚留香自动请缨前往平乱，被原随云极力阻止。楚遂暗中往谷底搜查枯梅行踪，卒在谷底发现其尸首，华真真睹状为之痛心欲绝。

楚留香往劫走薛衣人等，原随云趁机不断在仁宪面前恶言中伤楚，另一方面，原更利用灵芝下毒陷害仁宪，被小静发觉，但苦无证据，反被仁宪痛斥一顿。

仁宪见自己体质日渐衰弱，遂向朝廷公布另立原为太子。正当举行册封大典时，楚留香突赶至揭穿原随云非仁宪亲子，顿使满堂哄动。

楚留香当众展示枯梅师太临死前所写下血书，原随云顿百辞莫辩。楚更藉丁枫证实原随原为蝙蝠公子的化身，原随云老羞成怒下，抢走小静，众人顿不知所措。

原随云一直胁持小静逃去，灵芝跟随二人，原随云大为反感。灵芝见原随云对小静百般关怀，顿醋意大生，故意放走小静逃出生天，以藉此拆散二人。

小静逃回段将军府时，偶遇丁枫，并游说他为仁宪效忠，又劝他交出蝙蝠宫资料，决意合力铲除蝙蝠宫。

原随云心有不甘，决向丁枫报仇，并迫令仁宪就范，英万里舍身护驾，原随云无奈败逃。

古大鹏乘胡铁花等饥馑之危，攻上华山袭击众人，幸楚留香赶至克制古势力，古大鹏迫于逃亡投奔蝙蝠。

仁宪率众回京重掌朝政，将四皇爷发配疆外。另一方面，仁宪经过诸多变幻后，顿感心力交瘁，决意将帝位传予盛兰，盛兰经薛茵劝导后，终允负起重责。

蝙蝠宫重整旗鼓后，四出扰乱民安，引起混乱。楚留香遂联络玄空道长及亚男等，合力商讨对抗蝙蝠宫之策。

楚留香故意利用灵芝误引原相信所施对策，轻然大举歼减蝙蝠宫。原随云心心不忿，欲相约楚决斗。灵芝饱受相思之苦良久，不忍原随云败于楚留香手上，毅然与原随原同归于尽。

楚留香向小静直言彼此性格不合，未能共同双宿双栖，小静唯凝望楚远去，眼泪不禁涔涔而下。究竟楚留香与小静是否就此各散东西呢？请到时收看比剧大结局。