郭鸿翔到兖州后马上召集包括吴兴武等在内的多名官员训话，认为当中必定有人诬告钦差大臣。通判胡宁和知县黄耐东、知县赵兴成求见郭鸿翔，承认举报信是他们三人所发，原因是秦升曾分别和他们谈话，名义上了解赈灾事务，言语中暗含敲诈之意。郭鸿翔据三人证词奏明朱元璋。朱元璋决定亲赴兖州查办此案。秦良纲于途中觐见朱元璋。朱元璋准其随从前往兖州探望秦升。

朱元璋在兖州府衙大堂御审秦升，胡宁、黄耐东、赵兴成等人出庭作证。胡宁还招认派往京城给秦家送去书箱的商人王克勤是他的朋友。朱元璋提审王克勤，王在堂上指认命他送书箱回家的就是秦升。在而后的审讯中，胡宁等人坚持原来的供词。

案情对秦升不利，朱元璋向张子恭询问秦升的情况。张子恭表示并没有发现秦升有索取贿赂嫌疑，不过，他透露曾有女子半夜出入秦升的房间。朱元璋无奈之下命郭鸿翔审讯秦升。

秦升在酷刑之下招认曾分别向胡宁、黄耐东、赵兴成索贿共计黄金三百四十两，白银五百一十两，以及金银首饰、珠宝首饰七件。又怕带在身边不便。故命胡宁安排商人王克勤替他将财物送往家中。鉴于秦升受刑中腰椎病发作，朱元璋命人将其暂押在狱中。

收押秦升后，朱元璋命张子恭继续视察赈灾事务，而后一行人离开兖州。

苏州知府蔡玄闻报十分高兴，料定朝廷还会派钦差巡查苏州，届时再做打算。

离开兖州后，朱元璋暗中更换便衣，让朱标和韩宜可陪同返回兖州，查访秦升案实情。从百姓处得知秦升玫绩，朱元璋以大理寺少聊郭鸿翔对秦升实施的同样严刑审问郭鸿翔。郭鸿翔最终供认，吴曾派同知喻顺喜贿赂他黄金百两，并以此威胁他在这次办案中予以配合。至此，吴光武和喻顺喜等人栽赃陷害秦升一案水落石出，吴喻两人也被收押。

经历过兖州一事，朱元璋对秦升备加信任，命其处理完兖州事务后，以钦差大臣身份继续巡视苏州。

苏州知府蔡玄曾因贪污80贯钱而带罪任职。他已经对兖州发生的事情有详细了解，还打听到秦升喜欢字画和下棋，以及患有腰椎病的情况。秦升到苏州巡视河堤时，果然又受腰椎病痛困扰。

蔡玄早已让人寻得名医，为秦升治疗腰病。

秦升的腰痛病经名医诊治果然缓解，因此对蔡玄也有了好感。交谈中，蔡玄引用围棋术语形容抗灾，和秦升谈起围棋技艺，话题又引入书画，均是秦升的喜好。

秦升虽然表示不会放松对苏州的督查，心中对蔡玄的好感却日益增加。因腰痛病得以缓解，秦升决定到蔡玄府上拜谢。蔡玄为了能够进一步拉拢秦升，不仅挂出了南宋名画《四梅花图》，还特意安排了一位美貌非凡的女子。

在蔡玄书房，秦升果然对《四梅花图》表现出极大兴趣。蔡玄在一旁说明该画是仿南宋杨补之作品，有意相送。秦升连忙推脱不受。

蔡秦下棋期间，传来琵琶声和女子的歌声。秦升顿时被歌声吸引。蔡玄说是弹琵琶的是其远房侄女蔡钰，叫出来与秦升相见。相见之下，秦升被蔡珏的姿色和气质吸引。

回到驿馆，秦升辗转反侧、难以入睡，感觉对方像是设下圈套，却又怀疑是自己多心。

蔡玄知道秦升对《四梅花图》念念不忘，于是借机索取秦升的字，并以交换名义将《四梅花图》的真迹送给了秦升。

蔡玄见一计成功，遂使出连环计，在酒中下药，迷倒了秦升。而后，他又让蔡钰施以色相引诱秦升就犯。就在两人亲热之际，蔡玄和同知梁贸泉闯入屋内捉奸在床。秦升对蔡钰确实情有所钟，虽受蔡玄胁迫，却也心甘情愿地要娶蔡钰。

这时，张子恭和王林向秦升通报审讯南大仓官员刘长禄的结果，原来南大仓的粮食确实在水灾来到之前便被人运出大半，此事与同知梁贸泉有直接关系，估计蔡玄也不会不知道，而北、西、东大仓的情况也很相似。已经无心查办赈灾事宜的秦升听过报告，没有马上处理。

蔡玄设计贿赂秦升之后，又以钱财打点张子恭和王林，而后又献上“百寿图”让秦升带回京城献给皇帝。

因为收了贿赂，又有蔡钰这层关系，秦升在朱元璋面前竭力袒护蔡玄和梁贸泉。

秦升回到家中，向妻子孙凤娟透露了想要纳妾的想法。适逢蔡钰从苏州捎来信笺，秦升不顾家人劝阻，毅然前往苏州与情人相会。

早朝，朱元璋召见秦升商议前往太仓、昆山一带视察事宜，户部尚书禀报秦升已经前往苏州治病。韩宜可对此表现出疑惑之情。

韩宜可觉得秦升前往苏州可疑，向朱元璋禀报。朱元璋认为韩宜可的怀疑有道理，遂令其派人前往苏州调查秦升，而他则带领太子朱标等人赶前太仓一带视察。

韩宜可很快得知秦升到苏州住在蔡家，探望的是蔡玄的远房侄女蔡钰。据说，蔡玄已将蔡珏许配秦升为妾。朱元璋感觉事情复杂，命出巡队伍改道前往苏州。

秦升贸然回到苏州和蔡钰相会，招至蔡玄责怪。蔡玄告诉秦升，原来要视察太仓的朱元璋已经改道苏州。秦升安慰蔡玄，表示自己马上就要离开。蔡玄则告诉秦升已经来不及走了。

秦升见到朱元璋，极力维护蔡玄和蔡钰。蔡钰也坚持表示和秦升是两情相悦，并非有意拉拢。朱元璋见蔡钰在重刑之下依然不改供词，便将其释放，另将秦升、蔡玄、梁贸泉等人带回京城，连同张子恭、王林等人一起送交大理寺审理。

案情关键在于秦升是否收受蔡玄贿赂。据蔡府家丁举报，蔡玄曾送秦升价值黄金千两的古画《四梅花图》。朱元璋命人搜查秦府，果然搜出《四梅花图》

经鉴定该画实为赝品。一时间，案情似乎对秦升、蔡玄等人有利。朱元璋下令将秦升等人释放。

等秦升回到家中，朱元璋又命人火速搜查秦府。这时，秦升和管家正在卧室中搬开床铺。突然闯入的兵士令秦升脸色大变。兵士们搜出了藏匿的《四梅花图》真迹。原来，秦升自己曾收藏有一幅《四梅花图》仿品，从蔡玄处得到的确实是幅真迹。

朱元璋将秦升、蔡玄等人一并判斩。蔡钰削发为尼。