为了救被绑架的詹姆斯，少年侦探团努力推理他留下的“P&A”的意思。他们还得到了佐藤警官等的帮助，向犯人发起追击……

柯南与小兰到了小五郎朋友的餐厅。当晚“花乱亭”的主人花冈因为喜欢钓鱼，在制作钓鱼工具的时候死亡。这是事故还是杀人呢……

小五郎与柯南、小兰在去温泉的路上，去看秀友的500年忌日镇魂奠礼。因为看祭奠遇上大雪而不能去温泉，他们到偶然认识的大门家次男实家住宿。

当晚发生了奇妙的杀人事件。大门源一郎被带走杀害，但却没有被带走的足迹！长男穿着铠甲死去。是秀友的诅咒？长男自杀？感到奇怪的柯南开始推理

在有平次出场的剑道比赛的中，有大学生被杀。最初尸体被发现的现场却找不到尸体，反而在其他的地方发现了。平次在柯南等人到达比赛会场之前找出犯人。次日平次、柯南等到大阪城游玩，结识了崇拜秀吉的同好会参加者。在大阪观光之后回到大阪城的柯南等又遇上了事件。得知这次的事件与13年前发生的烧死尸体案件有关之后的平次和柯南开始推理。

英理为案子的嫌疑人宇佐美辩护。宇佐美坚持杀人事件发生时什么都不记得了。英理等人到宇佐美前妻经营的酒店去调查。小五郎说事件发生时宇佐美也在店里。