在新制品的创意会上，被采用的平松正树刺杀了社长梅谷四朗，而乘车逃走的中途坠下悬崖死亡。警方判断为事故，柯南却确信此为杀人事件。看到梅谷被平松刺杀时的录像带后的柯南从某种奇妙的违和感中解明了事件真相。

古装剧小说家月形龙太郎的弟子久坂雄一绞死的尸体在公园被发现。以前，接受过月形的取材采访的毛利小五郎怀疑跟久坂争夺弟子座位的猿桥胜。但是很快猿桥的不在场证明就得以证实。在柯南拼命思考的时候，月形的著作上“逆转接着逆转”的文字跳入眼帘。这时终于注意到不在场证明的柯南将有关者聚集起来……

柯南去看望同学片冈纯，结果被人误认为是纯而遭到绑架。很快，绑架犯吉泽正向纯的父亲片冈茂电话要求赎金3千万圆。并且指名交付赎金的得是片冈的将要再婚的对方江崎幸子。吉泽在公园得到放有幸子送去的赎金的蜂蜜便当，乘轻四轮车逃走。但是，在警察的追踪中，车子突然在隧道里消失了。

被误认为同学片冈纯而遭到绑架的柯南成功的从废弃建筑的地下室逃脱回来。很快绑架犯吉泽正发现被绞死在停在停车场的轻型四轮车中。看到车子的柯南确信这就是运走自己的绑架逃逸车。并且注意到了车子接到赎金从隧道中消失的手法……

等待平次和和叶两人的柯南看到到了约定时间2人还没出现，十分担心。这是小兰想起平次去见一个名为楠川的侦探。很快，柯南等人到访楠川公寓寻找线索，到了律师伊藤美沙里家。然而她说完全没有见过平次等人。

但是，平次和和叶被监禁在她家屋顶里……平常和和叶被不怀好意的律师美沙里所监禁，强迫解读侦探楠川留下的暗号。另一方面柯南他们在寻找平次，但没有找到，于是先到餐厅吃饭。这时接到了平次打到手机上的电话。平次说“帮我解个暗号”，看到这点的柯南……