藏海怀揣着沉甸甸的身世秘密，怀着一腔悲悯与决然，自愿觐见当今皇帝，将自己真实的出身——蒯铎独子稚奴——一一坦诚。他无惧旧案翻出血雨腥风，把蒯氏一门蒙难、亲人惨遭灭口的前尘旧事原原本本地诉于帝前。皇帝闻言，回忆起幼时的情分，心生百感交集。年少时，蒯铎与皇帝曾是肝胆照人的知己，年少轻狂，携手共度风雨，蒯铎甚至曾以性命护友，两家深情厚谊，曾经无间。皇帝心中既有愧疚，亦有隐痛，于是命藏海寻回失落多年的癸玺，更交付他一柄断佞剑，以作斩除仇寇之用，让他得以继续追查沉冤未雪的家仇。
明知仇人的权势如日中天，藏海却毫不退缩，他决定自内阁首辅石一平着手，探查真凶的蛛丝马迹。暗夜中，他最信赖的恩人，那位沉默寡言、常戴面具的神秘人，与挚友高明一同为他忧虑，也为他献计献策，只为助藏海平安完成复仇大业。千钧一发之际，神秘面具人看准时机，毅然摘下面具，显露真容。藏海惊愕至极，眼前之人正是赵秉文。他不禁热泪盈眶，往昔疑雾顿时明白分明。
赵秉文将一只雕花木鹿郑重递还藏海，那正是年前父亲蒯铎留给他、寄托绵绵父爱的遗物。这一瞬间，时光仿佛倒流，藏海跪地叩谢，感激之情溢于言表。赵秉文红了眼眶，往昔深藏心底的故事也终于娓娓道来。多年前，因查处贪腐工程案，他遭众多权贵联手陷害，唯一敢为他仗义执言便是蒯铎。恩怨情仇如刀割，他被斥逐远地，心中誓言必将回报蒯铎救命之情。后来，两人以书信维系情谊，赵秉文声名鹊起，回京为官，而蒯铎则远赴冬夏，主持修筑封禅台。忽有一日，赵秉文接获蒯铎密信，欲求接应家小离京避祸。他日夜兼程赶赴，然而终究迟了一步，蒯家血劫已至，仅余幼子稚奴。赵秉文义无反顾，救下稚奴，将之托付给星斗大师寄养教导。
往事沉重如山，藏海得知真相，心中五味杂陈，对赵秉文更添敬佩和感激。不仅如此，赵秉文亦全情投入，为查明第三位仇人而与藏海同心协力。第三人正是权倾朝野的内阁首辅石一平，由于地位尊崇，轻易难以接近。赵秉文连夜遣人呈上拜帖，约石首辅会晤，为藏海探查真相铺开道路。
夜色沉沉，万籁俱寂，藏海翻来覆去难以成眠。月下，高明走访谈心，诉说起自己与赵秉文结下的深缘。高明自小无依无靠，幸得赵秉文出手相救，结下师恩如山。一同受恩的六初和蒙救的星斗大师自此也心甘情愿追随赵秉文。香暗荼闻知，原来八公子铜儿的父亲正是藏海的救命恩人，不由感慨造化弄人，世事纠结，分分合合皆有因缘。她郑重叮嘱藏海，切记去石府探查务必步步为营，小心行事。
天光乍亮，藏海随赵秉文拜会石一平。厅堂之上，三人寒暄几句，赵秉文替藏海进言，望石首辅能多加提携。石一平老谋深算，隐约猜出藏海意图，直指他是为查曹静贤之死而来，藏海并未否认，表以坦然。石一平反倒慷慨鼓励，让藏海放手去查，并允予全力协助。藏海察觉石一平应对自若，无露毫厘破绽，却注意到石府高悬的名画——玉仞山风光图——此画正是冬夏名山的传世佳作，暗中记下此线索。
夜深人静时，藏海再次入石府，特意携带两幅珍品名画以表敬意。石一平明白藏海非丹青爱好者，反觉他别有用心，内心生出疑虑，表面却保持风度。他断言藏海无权查案，并欲面奏天子，亲自申请彻查此案。此时，藏海不卑不亢，言辞犀利，反将石一平驳得哑口无言。忽然，石一平口吐鲜血，随即昏厥倒地。藏海一惊，怀疑茶中有毒，尚未搜索线索，陆烟突至欲图刺杀。霎时间，形势数变，侍卫们合力擒拿陆烟，陆烟却誓死守秘，自刎身亡。石府风云骤变，石一平也命丧毒手，府邸一时陷入慌乱。
锦衣卫孙德芳带人搜查石府，癸玺阴影下疑云密布。藏海在一幅精致画作之后发现暗格之谜，亲手揭开机关，从中取出癸玺及一只铜鱼。事不宜迟，孙德芳即刻带藏海觐见皇帝。藏海禀述石一平欺骗在先、毒害厂卫、秘密盗藏癸玺的真相，同时将断佞剑尽数奉还。更附带请求皇帝将“玉仞山风光图”赏给自己，皇帝满口应允。
与此同时，赵秉文得悲喜参半的消息。昔年蒯铎曾将癸玺上交朝廷，却私留铜鱼一尾，唯恐皇帝借此重器起兵动武，引发血雨腥风。赵秉文黯然失神，梦魇深重，始终未能释怀这一劫数。香暗荼悄然探望藏海，只见他借酒浇愁，对着窗外发呆。藏海虽目睹石一平身亡，心底却并无慰藉之感，他反倒愈发疑窦丛生，石一平未必真凶，幕后真主疑影重重。香暗荼温柔劝解，许诺陪伴左右，无论风雨艰辛，皆不离不弃。此后，藏海下定决心，告别官场，放弃纷争名利。
旭日初升，藏海将心意告知高明，诉说自辞官念头，只愿携香暗荼看尽江山美景、远行四海，同时去探望一生恩师星斗大师。高明先愣后笑，坚定表达对藏海的行止充分支持和祝福。他们的友谊，经受风霜与血泪，于世事动荡中变得弥足珍贵。另一边，朝堂之上风云不息，皇帝犒赏赵秉文，望其继任内阁首辅。赵秉文自知身负重任，不敢轻慢，只求暂代首辅之职，以缓解天下之忧。
是非成败转头空，江山社稷、权谋争斗，不过过眼云烟。藏海于亲情、友情、家仇国恩中辗转沉浮，终于参透人生真意。当所有谜案终已水落石出，恩怨得谢，藏海选择卸下重担，去追寻真正心中的自在天地，与知心人香暗荼结伴天涯。从此一段传奇，化作风中旧梦，流传于世人心口，成为一代人传唱不息的佳话。