为了得到现在行踪不明、传说中的三人之一的纲手的消息，鸣人和自来也展开旅程。自来也一方面保护鸣人免受已经成为谜之组织‘晓’一员的宇智波鼬的追击，另一方面又对他进行修练。看见缠着自己要学新忍术的鸣人，自来也不禁想起了自己以前的徒弟－第四代火影，还把鸣人跟年少时的自己重叠起来。 另一方面，小樱前往探望受了鼬幻术攻击昏迷的卡卡西，却意外的知道了重大的事实。那就是，佐助那个摧毁自己一族人的哥哥宇智波鼬再次在木叶出现，还有就是他正在追击着鸣人。佐助向着自来也和鸣人身处的宿场町发足狂奔…