捕鲸船发信号请求援助，善良的船长和海尔兄弟他们把捕鲸船上的人接到大船上。克鲁德发现他们带有刀，惊呼。原来那些捕鲸船员也是一群海盗，妄想劫持万吨轮。大家与海盗搏斗，最终失败，被囚船舱。克鲁德、詹妮和海尔兄弟巧妙发出了求救信号，引来直升机将海盗们一网打尽。

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海尔兄弟一行人驾驶海盗留下的船与大船分别。途中遇到受伤的抹香鲸，抹香鲸只认船不认人，亦欲置爷爷他们于死地。詹妮通过声纳唱歌，感动了抹香鲸，终于化解了仇怨。“让轻轻海风告诉你我的愿望，让美丽波涛传来你的善良。”

克鲁德和詹妮钓鱼，却钓上来一条大章鱼。后来，由于受到两个龙吸水夹攻，船被击碎，大家陆续跳海。爷爷、海尔弟和詹妮用残破木板漂流，一路上寻找克鲁德和海尔兄。

克鲁德和海尔兄坐在大海龟背上，抵达一个小岛，最后却惊讶地发现这个岛自己在转。他们在岛上发出信号，并看见了爷爷他们。最后成功地逃离了旋转岛。

经过长期的水上漂流，终于看到了陆地。陆地上许许多多的飞机和坦克使他们感到疑惑。最后终于发现这是一个核试验场。而核爆炸的倒计时不多了，海尔兄弟精确估计，终于确保大家在核爆炸的一瞬间，潜入水下逃过一劫。

克鲁德被海浪冲到岸边，后来掉入蛇洞。爷爷他们找到克鲁德并和一老人相识。老人说他是一名日本军人，二战时期被空降到这个孤岛上直到现在。海尔兄弟利用闪锌矿和老人留下的仪器制成了简易收音机，并听到了日本首相的讲话。老人流泪了。“无边的长夜梦里故乡，千万次的呼唤不再彷徨，越过无尽的高山大海，去寻找永恒和平阳光。”