1991年春，侵华日军第731部队罪证陈列馆的馆长成铭，带着工作人员从一名原老平房的居民手中收集到了731部队用于研究细菌的玻璃器皿和烧杯等物品。这些物品原本是为了保存731部队在细菌武器研究中的罪证而收藏的。日本宣布战败之前，731部队的头目石井四郎曾亲自用火药和迫击炮摧毁了所有指向731部队研究细菌武器的直接证据。然而，石井四郎没有想到的是，胆大的老百姓竟然从废墟中挖掘出这些玻璃器皿，并将其带回家中使用。随着这些证物的现身，731部队的罪行不再是隐秘的历史，而是逐渐昭然若揭。这些破碎的证据，再过多久依然需要经过严格的消毒处理，这让人联想起了1941年夏的那次大规模消杀事件。
佟长富在外面寻找了一遍，却没有找到玉兰的踪迹。家中情况堪忧，太奶的神智渐渐模糊，桂芬忍不住在一旁抹眼泪。与此同时，关东军防疫给水部的吉村班在处理鼠疫问题时，宫崎舞子最终因败血症鼠疫不幸死亡，尸体可怖，身上布满了黑紫色的创口，惨状令在场的人无法直视。荒川良平的职责是将这些创口的情况一一记录下来，他见到川口聪面无表情、神情恍惚，内心也难免感到一阵惋惜。而特设监狱内的犯人们，则对清场工作不予配合，甚至发动了绝食抗议。荒川良平被安排去与这些犯人沟通，希望能劝说他们配合。没想到，他竟然被派去与犯人们谈判，自己也感到非常意外。
七号楼和九号楼的犯人们，似乎都只听从一个名为909号的犯人的指挥。荒川良平对此感到困惑，不知道909号究竟有什么特殊之处，也不了解所谓的“马路大”是什么意思。高桥明彦向他解释说，909号的存在自从加茂部队还驻扎在中马城时期就开始了。高桥明彦猜测，909号之所以能活这么久，是因为他拥有读心术，甚至能隔空操控他人的思想。他提醒荒川良平，在与909号谈判时务必小心，千万不要直视他的眼睛。很快，荒川良平便被带进了四方楼，见到了909号，并从他口中得知了许多关于“马路大”的事情。
“马路大”在日语中意味着“圆木”，但在这群犯人的眼中，它代表着他们是随时可以被消耗掉的实验工具和材料，根本不值一提，早已被用来感染细菌。荒川良平第一次听到“马路大”的惨叫时感到极度震惊，但对909号而言，这种声音已经习以为常。因为在这里，从早到晚，惨叫声不断，几乎没有一刻是安宁的。909号领导的绝食抗议并不是偶然，他的目的至今仍然无人知晓，荒川良平只是一个被派来进行沟通的外来者。最终，909号提出了一个条件，他要求荒川良平将自己的诉求传达给中留金藏：释放被关押在监狱中的孩子们，否则他们将绝不配合消杀工作，最终将所有人一同置于死亡的边缘。
在特设拘所内，小岛幸夫和严炳瑞两人都被关押着。严炳瑞渐渐看透了眼前的一切，所谓的“东亚共荣”不过是为了掩人耳目，给像小岛幸夫这样的人继续做春秋大梦的机会。他与小岛幸夫彻底闹翻，明确表态称这里是中国，而不是他们所说的“支那”。此时，一支部队缴获了日军的一批军用物资，其中满是药品。而与此同时，玉兰被带到喜福会客栈，却发现那里已被查封。后来，他们又被一位女子带到了荟芳里德凤的住处，准备为玉兰使用药物。正当他们准备施药时，忽然听到了军靴的声音，三人迅速通过窗子逃离，生死未卜。
荒川良平将909号的诉求转达给了中留金藏，并获得了答复——那三个孩子将被释放。在与909号短暂的交流中，荒川良平得知，909号并没有如高桥明彦所说的那般拥有特殊能力，他所说的读心术和隔空控制的能力，不过是为了给那些刚到马路大的新生犯人带来一线希望，免得他们在恐惧中死去。至于消杀工作，909号承诺会配合。他说，这样的生活已经够苦，至少给大家一个死而无悔的理由。天理村的小笠原团长被单独叫了出去，他不断翻看那一纸通知，眼神中透着不解与茫然。