伊札贝岛神奇宝贝华丽大赛!小心劲敌! 为了在最后的道馆赢得徽章，小智等人到达召开神奇宝贝华丽大赛的伊札贝岛的普里加市。小遥带着妙蛙种子挑战第四个缎带勋章，很幸运地轻松通过第一次审查。另一方面，会场一个穿着绿色衣裳的挑战者哈利，带着「恶神奇宝贝」梦歌奈亚连战连胜。不知为何原因，小遥感受到这个人对自己似乎怀有恶意...

封印巨大念力土偶 以赢得第八个徽章为目标的小智等人，在横越伊札贝岛的途中，来到了毁灭之谷。在那里，遇到老人重盛，在其带领下前往传说封印巨大力量的巨大神奇宝贝球所在的湖泊。此时，闻风而来的火箭队跑出来了。就在火箭队想夺走巨大神奇宝贝球的时候，球的封印被解开，巨大的念力土偶苏醒了。小智等人依靠着重盛的古文书，挺身对抗巨大念力土偶...

大嘴娃谈恋爱莲帽小童的花之路 旅行途中小智等人在原野上稍做歇息。这时小智为了小试身手，与小刚很难得地做神奇宝贝对战赛。然而战斗中，煤炭龟的「重击」力道过强，把莲帽小童炸飞掉，撞到森林中的欺骗神奇宝贝大嘴娃。大嘴娃迷上莲帽小童，莲帽小童一点也不领情。另一方面，小遥看过训练家莎由梨的缎带舞绝活之后，对大嘴娃大感兴趣。然而，远方还有一群可疑人物看上了大嘴娃...

大颚蚁与超音波幼虫梦幻之湖 向伊札贝岛前进的途中，小智等人误入了广大的荒野。那里，有着「狮蚁神奇宝贝」大颚蚁的巢穴。一行人在那里认识了保护巢穴安全的管理员，秋子，及大颚蚁的研究员平八郎。他正寻找大颚蚁制造的地下迷宫所在地的湖泊。这时火箭队的人又来偷袭了。并导致皮卡丘掉进大颚蚁的巢穴中...

阿勃梭鲁悄悄靠近的灾难阴影 小智等人以赛罗斯镇为目标而旅行的途中，来到了山势险峻的岩山山麓的利亚多村。最近在这个村庄出现了罕见的灾祸神奇宝贝阿勃梭鲁，村民们正为了可能发生的灾祸而困扰。村子的少年阿德说他的哥哥小聪为了证明灾祸并非阿勃梭鲁引起，而离开了村子。小智等人遂陪伴阿德寻找小聪。另一方面火箭队伪装成阿勃梭鲁猎人，企图找机会夺走皮卡丘...

抓住雪童子! 小智等人以拿到丰缘地方第八个徽章为目标而旅行，来到了伊札贝岛的山顶。在那里，小智的徽章盒被喜好恶作剧的雪笠神奇宝贝雪童子抢走。小智在暴风雪中拼命追逐，在很陡的斜坡上滑倒，掉到山谷的深处。不只这样，皮卡丘想要救出小智，却与雪童子一起被火箭队抓住...