禁忌森林的国王妙蛙花 以茵郁市为目标的小智等人，途中在森林里迷路，小遥被突然跳出来的盔甲鸟给带走。小智等人急忙追上去，却遭到厚重的木门与一群神秘男子的阻挡。这些人是住在森林的村民。对他们来说，门的另一边是禁地，自古以来就为人所畏惧，据说，进入里面的人会触怒草系神奇宝贝。一心想要赶快救出小遥的小智等人，趁村民不注意时偷偷爬过大门，可是…。另一方面，小遥被带进禁地之后，被妙蛙种子、臭臭花、口呆花等「草系神奇宝贝」所包围…

妙蛙种子与妙蛙种子抢回神奇宝贝球 小智等人路过一个都市，使用神奇宝贝中心的电视电话与大木博士取得连络，让博士传送小智的妙蛙种子过来，与小遥的妙蛙种子一起玩耍。然后，传送开始了，可是什么东西也没有过来。原来是有人伪装成技师，假藉修理故障的机会，改造传送机，将传送过来的神奇宝贝球夺走。为了拿回被偷走的神奇宝贝球，小智等人赶忙追上去，但是…

对决巨大鲶鱼王与钓鱼高手 小智等人在湖畔休息。小智观赏着目前为止战胜得来的徽章太入神，一不小心让徽章与盒子一起掉进水中。此时巨大鲶鱼王突然出现，将盒子连徽章一口就咬走掉。为了追回盒子，小智情急之下跳湖，搞得自己也溺水。刚好在场的钓客出手将小智救起。这位钓客看起来与巨大鲶鱼王似乎有某种关连…

天秤偶与雾中的遗迹 为了参加丰缘联盟的比赛而持续旅行的小智一行人，决定要爬上迷雾山。可是，在深雾笼罩的山中，小智和皮卡丘却跟大家走失了。迷路的小智突然遇到雾中出现的神秘婆婆。这个婆婆一边唱着奇怪的童谣，又消失在雾中。继续迷路的小智与皮卡丘因为救了差点跌落悬崖的天秤偶，又遇到了名叫神代的少女。调查梦幻般的古代遗迹的她，就是以先前小智听到的奇怪童谣当线索...

强敌!妈妈协调训练家登场! 旅行途中小智来到了长寿镇。小遥得知镇上即将举办神奇宝贝华丽大赛，非常的高兴。遇到宿敌小瞬，两人果然又迸出火花，但是一群妇女们的热烈加油声，却让两人吓一大跳。而且，自称"pmdm"神奇宝贝爱好妈妈的成员之一人，月子也要参加比赛。小遥与月子成为好朋友，见月子紧张的样子，提出建议让自己成为练习的伙伴。另一方面，火箭队得知只有拥有缎带勋章的人可以参加比赛，而动起抢劫小遥的歪脑筋...

神奇宝贝华丽大赛!长寿大会! 长寿镇的神奇宝贝华丽大赛终于开始了。狩猎凤蝶表现不错，令小遥显得很从容。一同练习的月子也恢复了比赛的直觉，表现得可圈可点。宿敌小瞬则是以毒蔷薇的花吹雪绝招让在场观众陶醉不已。虽然第一次审察大家都顺利通过，可是第二次审察时，小遥的对手居然是月子。小遥兴冲冲的想让妙蛙种子的出道比赛制造高潮，但是...