于振甲自认问心无愧，冒死护堤也是为守护百姓，尽管引来黄龙洪灾，这是任何人都没有想到的后果。但是康熙怒斥于振甲执意护堤全因顾着自己的名声，根本不在乎百姓死活，如今京师城外全都是三省行乞至此的难民，所谓清廉并非是指清廉，更多还要断事清明公正。
圣旨传至河督府，召靳辅入京与工部合议赔修，陈潢尚且不明赔修是何意，当他听闻要自己想办法掏钱修建大坝，扬言还不如进京坐牢。康熙总算是见到靳辅，质问他为何迟迟没有递来自辩的奏报，显然是不相信自己能够保护好他。
高士奇知道陈潢心地善良，同样有点妇人之仁，若非仗着皇帝的恩宠，恐怕他早就是身首异处。看似皇帝坐在皇宫里与世隔绝，实则任何事情都是心如明镜，包括陈潢怂恿于振甲劫运官粮，所以高士奇提醒陈潢凡事长点心眼。
没过多久，伊桑阿回京向康熙汇报查案经过，高士奇佯装是帮着伊桑阿邀功，其实是和康熙互相打配合，故意给他穿小鞋。康熙让高士奇高调拟旨嘉奖伊桑阿，顺便警告高士奇应守本分，为此高士奇吓得背后发凉，终于明白何为伴君如伴虎。
虽然靳治豫死罪可免，但是获罪难逃，康熙下令将其流放至乌里雅苏台，等到两年后事情平息再回来。临行之际，靳治豫拜别父母双亲，以及陈潢、郭河叔等人，靳辅陪送儿子到城门外。
也正因伊桑阿在皇帝面前吃瘪，急忙跑去向索额图倾诉，认为康熙和高士奇合伙害自己，现在等同哑巴吃黄连有苦难言。索额图反问伊桑阿既然已经去过秦淮河，怎么还会毫无反击之力，继而建议他多读些书增长学问。
今年秋汛将至，康熙没有十足信心能够渡过难关，虽然高士奇相信靳辅和陈潢，同样也不敢贸然笃定。事实上，陈潢早已想好对策，那便是炸毁老坝，舍大保小，通知桃源县全体百姓迁居。
然而炸毁老坝意味着任由洪水淹没桃源县，于振甲身为桃源县人，自然是不肯同意。陈潢耐心解释王登选修建的大坝外强中空，难以抵挡洪水冲击，若是熬过今年汛期，待到明年开春就能起到关键作用，如果洪水冲毁减水坝，恐怕将要祸及三省百姓。
可偏偏于振甲就是犟驴脾气，完全不听劝告，逼得陈潢扬言要告知靳辅下达命令。于振甲完全无惧官威，还要带着百姓加固堤坝，反过来指责陈潢等人治河五年毫无起色，每逢汛期都要往桃源县泄洪，令他彻底无法忍受。
之后于振甲带领桃源县全体百姓跪在河督府门外请命，靳辅好言相劝无果，继而搬出王命旗牌。此物犹如圣令不可违抗，于振甲失魂落魄走到门口向大家告知结果，众人闻言哭得撕心裂肺，哀号声不绝于耳。
随着降雨量越来越多，各地水位逐步上升，接二连三遭遇洪灾。靳辅派人通知陈潢疏散百姓，准备往桃源县泄洪。但是于振甲没有选择离开，继而带着自愿留下的男丁守着河道，眼看快要天亮，由于迟迟没有泄洪的缘故，最终引来黄龙过境。